Шикиматкиназа
Шикиматкиназа (Шифр КФ 2.7.1.71) представляет собой фермент, катализирующий АТФ-зависимое фосфорилирование шикимата с образованием шикимат-3-фосфата[1]. Эта реакция является пятым этапом пути шикимата[2], который используется растениями и бактериями для синтеза общего предшественника ароматических аминокислот и вторичных метаболитов. Систематическое название этого класса ферментов — АТФ: шикимат-3-фосфотрансфераза. Другие широко используемые названия включают шикиматкиназу (фосфорилирование) и шикиматкиназу II.
| Шикиматкиназа | |
|---|---|
 Шикиматкиназа из "Erwinia chrysanthemi". | |
| Идентификаторы | |
| Символ | SKI |
| Pfam | PF01202 |
| Pfam clan | CL0023 |
| PROSITE | PDOC00868 |
| SCOP | 2shk |
| SUPERFAMILY | 2shk |
| OPM superfamily | 124 |
| OPM protein | 1e6c |
| Доступные структуры белков | |
| Pfam | структуры |
| PDB | RCSB PDB; PDBe; PDBj |
| PDBsum | 3D-модель |
 Медиафайлы на Викискладе | |
| Шикиматкиназа | |
|---|---|
 Мультипликационное изображение шикиматкиназы из Mycobacterium tuberculosis. α-гели показаны красным цветом, центральный β-лист - желтым, а петли - зеленым. | |
| Идентификаторы | |
| Шифр КФ | 2.7.1.71 |
| Номер CAS | 9031-51-0 |
| Базы ферментов | |
| IntEnz | IntEnz view |
| BRENDA | BRENDA entry |
| ExPASy | NiceZyme view |
| MetaCyc | metabolic pathway |
| KEGG | KEGG entry |
| PRIAM | profile |
| PDB structures | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
| Gene Ontology | AmiGO • EGO |
| Поиск | |
| PMC | статьи |
| PubMed | статьи |
| NCBI | NCBI proteins |
| CAS | 9031-51-0 |
| Медиафайлы на Викискладе | |
Общее описание править
Путь шикимата состоит из семи ферментативных реакций, посредством которых фосфоенолпируват и эритрозо-4-фосфат превращаются в хоризмат, общий предшественник ароматических аминокислот фенилаланина, тирозина и триптофана. Ароматические аминокислоты используются в синтезе белков и в растениях, грибах и бактериях дают начало ряду других специализированных метаболитов, таких как фенилпропаноиды и алкалоиды. Хорисмат и несколько других промежуточных продуктов этого пути служат предшественниками ряда других метаболитов, таких как фолаты, хинаты и хиноны. Четыре фермента, которые предшествуют шикиматкиназы в этом пути, — это DAHP-синтаза, 3-дегидрохинатсинтаза, 3-дегидрохинатдегидратаза и шикиматдегидрогеназа, а два следующих за ним — это EPSP-синтаза и хоризматсинтаза. У грибов и простейших он является частью комплекса AROM, в котором совместно локализованы пять центральных стадий пути шикимате[3]. Путь не обнаружен у людей и других животных, которые должны получать ароматические аминокислоты из пищи.
Активность править
Реакция, катализируемая шикиматкиназой, показана ниже:
Эта реакция включает перенос фосфатной группы от АТФ к 3-гидроксильной группе шикимата. Таким образом, шикиматкиназа имеет два субстрата, шикимат и АТФ, и два продукта, шикимат-3-фосфат и АДФ[4].
Примеры править
Белки человека, содержащие этот домен, включают: MAPK7 и THNSL1.
Использованная литература править
- ↑ "Shikimate kinase isoenzymes in Salmonella typhimurium". The Journal of Biological Chemistry. 243 (3): 676—7. February 1968. PMID 4866525.
- ↑ "The Shikimate Pathway". Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology. 50: 473—503. June 1999. doi:10.1146/annurev.arplant.50.1.473. PMID 15012217.
- ↑ "Architecture and functional dynamics of the pentafunctional AROM complex". Nature Chemical Biology. 16 (9): 973—978. July 2020. doi:10.1038/s41589-020-0587-9. PMID 32632294.
- ↑ "Mechanism of phosphoryl transfer catalyzed by shikimate kinase from Mycobacterium tuberculosis". Journal of Molecular Biology. 364 (3): 411—23. December 2006. doi:10.1016/j.jmb.2006.09.001. PMID 17020768.