CAP1

CAP1
CAP1
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1K8F
Идентификаторы
Псевдонимы	CAP1, CAP, CAP1-PEN, CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast), adenylate cyclase associated protein 1
Внешние ID	OMIM: 617801 MGI: 88262 HomoloGene: 74572 GeneCards: CAP1
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	4-я хромосома мыши
Конец	122,779,849 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	н/д
	Наибольшая экспрессия в
	left lung lobe; ; right lung lobe;
	; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	adenylate cyclase binding; actin binding;
Компонент клетки	цитоплазма; клеточная мембрана; экзосома; мембрана; фокальные контакты; cortical actin cytoskeleton; внеклеточная область; внеклеточное пространство; azurophil granule lumen;
Биологический процесс	establishment or maintenance of cell polarity; ameboidal-type cell migration; рецепторно-опосредованный эндоцитоз; actin cytoskeleton organization; cytoskeleton organization; передача сигнала; activation of adenylate cyclase activity; cell morphogenesis; actin polymerization or depolymerization; neutrophil degranulation; regulation of adenylate cyclase activity;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	10487
	12331
	ENSG00000131236
	ENSMUSG00000028656
	Q01518; Q5T0R9
	P40124
	NM_001105530; NM_006367; NM_001330502
	NM_001301067; NM_007598; NM_001358035; NM_001358036
NP_001099000; NP_001317431; NP_006358; NP_001337404; NP_001337405;
	NP_001337406; NP_001337407; NP_001337408; NP_001337409; NP_001337410; NP_001337411; NP_001337412; NP_001337413; NP_001337414
	NP_001287996; NP_031624; NP_001344964; NP_001344965
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

CAP1 (англ. Adenylyl cyclase-associated protein 1) — белок, регулирующий динамику актина. Продукт гена CAP1^[4]^[5]^[6]

Функция править

Белок регулирует динамику актиновых филаментов и участвует в ряде комплексных процессов развития и морфологии, включая локализацию мРНК и установление полярности клетки^[7]. Белок экспрессирован практически во всех тканях организма^[7].

Структура править

Ген CAP1 близок по структуре с соответствующим геном CAP из S. cerevisiae, который играет роль в сигнальном пути цАМФ. Белок человека CAP1 взаимодействует с другим CAP1, а также с CAP2 и актином^[6]. Белок состоит из 475 аминокислот, молекулярная масса 51,9 кДа. Содержит домен C-CAP (319–453). Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 3 изоформ белка.

Взаимодействия править

CAP1 взаимодействует с ACTG1^[8] и CAP2^[5].

Литература править

Yu G., Swiston J., Young D. Comparison of human CAP and CAP2, homologs of the yeast adenylyl cyclase-associated proteins (англ.) // Journal of Cell Science^[англ.] : journal. — The Company of Biologists^[англ.], 1994. — Vol. 107, no. 6. — P. 1671—1678. — PMID 7962207.
Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene^[англ.] : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K. et al. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene^[англ.] : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
Moriyama K., Yahara I. Human CAP1 is a key factor in the recycling of cofilin and actin for rapid actin turnover (англ.) // Journal of Cell Science^[англ.] : journal. — The Company of Biologists^[англ.], 2003. — Vol. 115, no. Pt 8. — P. 1591—1601. — PMID 11950878.
Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — Bibcode: 2002PNAS...9916899M. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Gevaert K., Goethals M., Martens L. et al. Exploring proteomes and analyzing protein processing by mass spectrometric identification of sorted N-terminal peptides (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2004. — Vol. 21, no. 5. — P. 566—569. — doi:10.1038/nbt810. — PMID 12665801.
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
Dodatko T., Fedorov A. A., Grynberg M. et al. Crystal structure of the actin binding domain of the cyclase-associated protein (англ.) // Biochemistry : journal. — 2004. — Vol. 43, no. 33. — P. 10628—10641. — doi:10.1021/bi049071r. — PMID 15311924.
Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Rual J. F., Venkatesan K., Hao T. et al. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — Bibcode: 2005Natur.437.1173R. — PMID 16189514.
Fautsch M. P., Vrabel A. M., Johnson D. H. The identification of myocilin-associated proteins in the human trabecular meshwork (англ.) // Exp. Eye Res. : journal. — 2006. — Vol. 82, no. 6. — P. 1046—1052. — doi:10.1016/j.exer.2005.09.016. — PMID 16289162.
Oh J. H., Yang J. O., Hahn Y. et al. Transcriptome analysis of human gastric cancer (англ.) // Mamm. Genome^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 12. — P. 942—954. — doi:10.1007/s00335-005-0075-2. — PMID 16341674.
Gregory S. G., Barlow K. F., McLay K. E. et al. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — Bibcode: 2006Natur.441..315G. — PMID 16710414.
Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D. M., Giorgianni F. Phosphoproteomic analysis of the human pituitary (неопр.) // Pituitary. — 2006. — Т. 9, № 2. — С. 109—120. — doi:10.1007/s11102-006-8916-x. — PMID 16807684.
Garewal G., Das R., Awasthi A. et al. The clinical significance of the spectrum of interactions of CAP+1 (A-->C), a silent beta-globin gene mutation, with other beta-thalassemia mutations and globin gene modifiers in north Indians (англ.) // Eur. J. Haematol. : journal. — 2007. — Vol. 79, no. 5. — P. 417—421. — doi:10.1111/j.1600-0609.2007.00958.x. — PMID 17900295.

Примечания править

↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028656 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Matviw H., Yu G., Young D. Identification of a human cDNA encoding a protein that is structurally and functionally related to the yeast adenylyl cyclase-associated CAP proteins (англ.) // Mol Cell Biol^[англ.] : journal. — 1992. — November (vol. 12, no. 11). — P. 5033—5040. — PMID 1406678. — PMC 360436.
↑ ¹ ² Hubberstey A., Yu G., Loewith R., Lakusta C., Young D. Mammalian CAP interacts with CAP, CAP2, and actin (англ.) // J Cell Biochem^[англ.] : journal. — 1997. — April (vol. 61, no. 3). — P. 459—466. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19960601)61:3<459::AID-JCB13>3.0.CO;2-E. — PMID 8761950.
↑ ¹ ² Entrez Gene: CAP1 CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast) (неопр.).
↑ ¹ ² Kakurina G. V., Kolegova E. S., Kondakova I. V. Adenylyl Cyclase-Associated Protein 1: Structure, Regulation, and Participation in Cellular Processes (англ.) // Biochemistry (Mosc)^[англ.] : journal. — 2018. — Vol. 83, no. 1. — P. 45—53. — doi:10.1134/S0006297918010066. — PMID 29534668.
↑ Hubberstey, A; Yu G; Loewith R; Lakusta C; Young D. Mammalian CAP interacts with CAP, CAP2, and actin (англ.) // J. Cell. Biochem.^[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1996. — June (vol. 61, no. 3). — P. 459—466. — ISSN 0730-2312. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19960601)61:3<459::AID-JCB13>3.0.CO;2-E. — PMID 8761950.

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000028656-1] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028656 - Ensembl, May 2017

[2] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1406678-4] Matviw H., Yu G., Young D. Identification of a human cDNA encoding a protein that is structurally and functionally related to the yeast adenylyl cyclase-associated CAP proteins (англ.) // Mol Cell Biol^[англ.] : journal. — 1992. — November (vol. 12, no. 11). — P. 5033—5040. — PMID 1406678. — PMC 360436.

[pmid8761950-5] ¹ ² Hubberstey A., Yu G., Loewith R., Lakusta C., Young D. Mammalian CAP interacts with CAP, CAP2, and actin (англ.) // J Cell Biochem^[англ.] : journal. — 1997. — April (vol. 61, no. 3). — P. 459—466. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19960601)61:3<459::AID-JCB13>3.0.CO;2-E. — PMID 8761950.

[entrez-6] ¹ ² Entrez Gene: CAP1 CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast) (неопр.).

[pmid29534668-7] ¹ ² Kakurina G. V., Kolegova E. S., Kondakova I. V. Adenylyl Cyclase-Associated Protein 1: Structure, Regulation, and Participation in Cellular Processes (англ.) // Biochemistry (Mosc)^[англ.] : journal. — 2018. — Vol. 83, no. 1. — P. 45—53. — doi:10.1134/S0006297918010066. — PMID 29534668.

[autogenerated1-8] Hubberstey, A; Yu G; Loewith R; Lakusta C; Young D. Mammalian CAP interacts with CAP, CAP2, and actin (англ.) // J. Cell. Biochem.^[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1996. — June (vol. 61, no. 3). — P. 459—466. — ISSN 0730-2312. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19960601)61:3<459::AID-JCB13>3.0.CO;2-E. — PMID 8761950.

[4]

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[7]

[8]