PLXNA2 — ген, кодирующий плексин A2, рецептор семафоринов. До создания в 1999 году общей классификации плексинов[5] носил название OCT, обусловленное принадлежностью к SEX-семейству белков, поименованных по начальным буквам римских цифр: SEX (плексин A3), OCT, NOV (плексин A1), SEP (плексин B1) и содержащих в своей структуре SEX-домен[6]. За исключением SEP, пик экспрессии которого наблюдается в почках, белки SEX-семейства экспрессированы преимущественно в мозгу.

PLXNA2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3Q3J

Идентификаторы
ПсевдонимыPLXNA2, OCT, PLXN2, plexin A2
Внешние IDOMIM: 601054 MGI: 107684 HomoloGene: 56427 GeneCards: PLXNA2
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме PLXNA2
Расположение в геноме PLXNA2
Локус1q32.2Начало208,022,242 bp[1]
Конец208,244,384 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме PLXNA2
Расположение в геноме PLXNA2
Локус1|1 H6Начало194,300,526 bp[2]
Конец194,499,177 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_025179

NM_008882

RefSeq (белок)

NP_079455

NP_032908

Локус (UCSC)Chr 1: 208.02 – 208.24 MbChr 1: 194.3 – 194.5 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)
Взаимодействие семафоринов с другими белками, плексином A2 и нейропилином 2, создаёт условия, при которых моторные нейроны спинного мозга способны выпускать свои аксоны на периферию, но не могут сами выбраться за его пределы. Bron et al., 2007.[7]

Взаимодействуя с семафорином Sema6A, плексин 2A[уточнить] может регулировать переход гранулярных клеток мозжечка у мыши от тангенциальной к радиальной миграции в период развития мозга[8].

Несколько исследований говорят о возможной связи гена с развитием шизофрении, однако результаты разнятся[9]. Отмечена ассоциация полиморфизмов гена с проявлением тревоги, как у мышей, так и у людей[10].

Примечания править

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000076356 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026640 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Tamagnone L., Artigiani S., Chen H., He Z., Ming G.I., Song H., Chedotal A., Winberg M.L., Goodman C.S., Poo M., Tessier-Lavigne M., Comoglio P.M. Plexins are a large family of receptors for transmembrane, secreted, and GPI-anchored semaphorins in vertebrates (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — October (vol. 99, no. 1). — P. 71—80. — PMID 10520995.
  6. Maestrini E., Tamagnone L., Longati P., Cremona O., Gulisano M., Bione S., Tamanini F., Neel B.G., Toniolo D., Comoglio P.M. A family of transmembrane proteins with homology to the MET-hepatocyte growth factor receptor (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — January (vol. 93, no. 2). — P. 674—678. — PMID 8570614. — PMC 40111.
  7. Bron R., Vermeren M., Kokot N., Andrews W., Little G.E., Mitchell K.J., Cohen J. Boundary cap cells constrain spinal motor neuron somal migration at motor exit points by a semaphorin-plexin mechanism (англ.) // Neural Dev : journal. — 2007. — Vol. 2. — P. 21. — doi:10.1186/1749-8104-2-21. — PMID 17971221. — PMC 2131750.
  8. Renaud J., Kerjan G., Sumita I., Zagar Y., Georget V., Kim D., Fouquet C., Suda K., Sanbo M., Suto F., Ackerman S.L., Mitchell K.J., Fujisawa H., Chédotal A. Plexin-A2 and its ligand, Sema6A, control nucleus-centrosome coupling in migrating granule cells (англ.) // Nature Neuroscience : journal. — 2008. — April (vol. 11, no. 4). — P. 440—449. — doi:10.1038/nn2064. — PMID 18327254.
  9. Gene Overview of All Published Schizophrenia-Association Studies for PLXNA2 Архивировано 21 февраля 2009 года. — база данных SZGene, сайт Schizophrenia Research Forum.
  10. Wray N.R., James M.R., Mah S.P., Nelson M., Andrews G., Sullivan P.F., Montgomery G.W., Birley A.J., Braun A., Martin N.G. Anxiety and comorbid measures associated with PLXNA2 (англ.) // Arch. Gen. Psychiatry  (англ.) : journal. — 2007. — March (vol. 64, no. 3). — P. 318—326. — doi:10.1001/archpsyc.64.3.318. — PMID 17339520. Архивировано 30 сентября 2011 года.