Википедия

POLR2A

Субъединица RPB1 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II , также известная как RPB1 , — фермент, кодируемый у человека геном POLR2A .

Полипептид A РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
Представлено на основе PDB 2GHQ.Представлено на основе PDB 2GHQ.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2GHQ, 2GHT, 2LTO, 3D9K, 3D9L, 3D9M, 3D9N, 3D9O, 3D9P, 4JXT

Идентификаторы
Символ POLR2A ; POLR2; POLRA; RPB1; RPBh1; RPO2; RPOL2; RpIILS; hRPB220; hsRPB1
Внешние ID OMIM: 180660 MGI: 98086 HomoloGene: 721 ChEMBL: 1641353 GeneCards: Ген POLR2A
номер EC 2.7.7.48, 2.7.7.6
Генная онтология
Функция • RNA polymerase II activity

• DNA binding
• DNA-directed RNA polymerase activity
• RNA-directed RNA polymerase activity
• protein binding
• ubiquitin protein ligase binding
• poly(A) RNA binding

• metal ion binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm
• DNA-directed RNA polymerase II, core complex

• nucleolus
Биологический процесс • mRNA splicing, via spliceosome

• transcription, RNA-templated
• DNA repair
• transcription-coupled nucleotide-excision repair
• nucleotide-excision repair
• regulation of transcription, DNA-templated
• transcription from RNA polymerase II promoter
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• transcription elongation from RNA polymerase II promoter
• 7-methylguanosine mRNA capping
• RNA splicing
• gene expression
• viral process

• positive regulation of viral transcription
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5430 20020
Ensembl ENSG00000181222 ENSMUSG00000005198
UniProt P24928 P08775
RefSeq (мРНК) NM_000937 NM_001291068
RefSeq (белок) NP_000928 NP_001277997
Локус (UCSC) Chr 17:
7.39 – 7.42 Mb		 Chr 11:
69.73 – 69.76 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Функция править

Этот ген кодирует большую субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез РНК у эукариот. Продукт этого гена содержит карбоксильный терминальный домен[англ.], состоящий из гептапептидных повторов, необходимых для полимеразной активности. Эти повторы содержат сериновые и треониновые остатки, которые в активном состоянии фосфорилируют транскрипцию РНК-полимеразы. Кроме того, эта субъединица, в сочетании с некоторыми другими субъединицами полимеразы, образует ДНК-связывающий домен полимеразы, в котором матричная ДНК транскрибируется в РНК.[1]

Взаимодействия править

POLR2A, как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания править

  1. ↑ Entrez Gene: POLR2A polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa.
  2. ↑ Krum S.A., Miranda G.A., Lin C., Lane T.F. BRCA1 associates with processive RNA polymerase II (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — December (vol. 278, no. 52). — P. 52012—52020. — doi:10.1074/jbc.M308418200. — PMID 14506230.
  3. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 Scully R., Anderson S.F., Chao D.M., Wei W., Ye L., Young R.A., Livingston D.M., Parvin J.D. BRCA1 is a component of the RNA polymerase II holoenzyme (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — May (vol. 94, no. 11). — P. 5605—5610. — doi:10.1073/pnas.94.11.5605. — PMID 9159119. — PMC 20825.
  4. ↑ Chiba N., Parvin J.D. Redistribution of BRCA1 among four different protein complexes following replication blockage (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — October (vol. 276, no. 42). — P. 38549—38554. — doi:10.1074/jbc.M105227200. — PMID 11504724.
  5. ↑ Krum S.A., Womack J.E., Lane T.F. Bovine BRCA1 shows classic responses to genotoxic stress but low in vitro transcriptional activation activity (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — 2003. — September (vol. 22, no. 38). — P. 6032—6044. — doi:10.1038/sj.onc.1206515. — PMID 12955082.
  6. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Cho H., Orphanides G., Sun X., Yang X.J., Ogryzko V., Lees E., Nakatani Y., Reinberg D. A human RNA polymerase II complex containing factors that modify chromatin structure (англ.) // Molecular and Cellular Biology[англ.] : journal. — 1998. — September (vol. 18, no. 9). — P. 5355—5363. — PMID 9710619. — PMC 109120.
  7. ↑ Suñé C., Hayashi T., Liu Y., Lane W.S., Young R.A., Garcia-Blanco M.A. CA150, a nuclear protein associated with the RNA polymerase II holoenzyme, is involved in Tat-activated human immunodeficiency virus type 1 transcription (англ.) // Molecular and Cellular Biology[англ.] : journal. — 1997. — October (vol. 17, no. 10). — P. 6029—6039. — PMID 9315662. — PMC 232452.
  8. ↑ Sato S., Tomomori-Sato C., Parmely T.J., Florens L., Zybailov B., Swanson S.K., Banks C.A., Jin J., Cai Y., Washburn M.P., Conaway J.W., Conaway R.C. A set of consensus mammalian mediator subunits identified by multidimensional protein identification technology (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 2004. — June (vol. 14, no. 5). — P. 685—691. — doi:10.1016/j.molcel.2004.05.006. — PMID 15175163.
  9. ↑ 1 2 3 4 Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.
  10. ↑ Humbert S., Saudou F. Toward cell specificity in SCA1 (англ.) // Neuron[англ.]. — Cell Press, 2002. — May (vol. 34, no. 5). — P. 669—670. — doi:10.1016/s0896-6273(02)00715-8. — PMID 12062012.
  11. ↑ 1 2 3 Sif S., Saurin A.J., Imbalzano A.N., Kingston R.E. Purification and characterization of mSin3A-containing Brg1 and hBrm chromatin remodeling complexes (англ.) // Genes & Development : journal. — 2001. — March (vol. 15, no. 5). — P. 603—618. — doi:10.1101/gad.872801. — PMID 11238380. — PMC 312641.
  12. ↑ 1 2 3 Wang W., Côté J., Xue Y., Zhou S., Khavari P.A., Biggar S.R., Muchardt C., Kalpana G.V., Goff S.P., Yaniv M., Workman J.L., Crabtree G.R. Purification and biochemical heterogeneity of the mammalian SWI-SNF complex (англ.) // The EMBO Journal[англ.] : journal. — 1996. — October (vol. 15, no. 19). — P. 5370—5382. — PMID 8895581. — PMC 452280.
  13. ↑ Zhao K., Wang W., Rando O.J., Xue Y., Swiderek K., Kuo A., Crabtree G.R. Rapid and phosphoinositol-dependent binding of the SWI/SNF-like BAF complex to chromatin after T lymphocyte receptor signaling (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — November (vol. 95, no. 5). — P. 625—636. — doi:10.1016/s0092-8674(00)81633-5. — PMID 9845365.
  14. ↑ Hamamoto R., Furukawa Y., Morita M., Iimura Y., Silva F.P., Li M., Yagyu R., Nakamura Y. SMYD3 encodes a histone methyltransferase involved in the proliferation of cancer cells (англ.) // Nature Cell Biology : journal. — 2004. — August (vol. 6, no. 8). — P. 731—740. — doi:10.1038/ncb1151. — PMID 15235609.
  15. ↑ Yang J., Aittomäki S., Pesu M., Carter K., Saarinen J., Kalkkinen N., Kieff E., Silvennoinen O. Identification of p100 as a coactivator for STAT6 that bridges STAT6 with RNA polymerase II (англ.) // The EMBO Journal[англ.] : journal. — 2002. — September (vol. 21, no. 18). — P. 4950—4958. — doi:10.1093/emboj/cdf463. — PMID 12234934. — PMC 126276.
  16. ↑ Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins (англ.) // Molecular and Cellular Biology[англ.] : journal. — 1999. — September (vol. 19, no. 9). — P. 5960—5968. — PMID 10454543. — PMC 84462.
  17. ↑ Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Ferdous A., Imai T., Hirose S., Sugimoto S., Yano K., Hartzog G.A., Winston F., Buratowski S., Handa H. DSIF, a novel transcription elongation factor that regulates RNA polymerase II processivity, is composed of human Spt4 and Spt5 homologs (англ.) // Genes & Development : journal. — 1998. — February (vol. 12, no. 3). — P. 343—356. — doi:10.1101/gad.12.3.343. — PMID 9450929. — PMC 316480.
  18. ↑ Conaway R.C., Kong S.E., Conaway J.W. TFIIS and GreB: two like-minded transcription elongation factors with sticky fingers (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2003. — August (vol. 114, no. 3). — P. 272—274. — PMID 12914690.
  19. ↑ Archambault J., Pan G., Dahmus G.K., Cartier M., Marshall N., Zhang S., Dahmus M.E., Greenblatt J. FCP1, the RAP74-interacting subunit of a human protein phosphatase that dephosphorylates the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase IIO (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1998. — October (vol. 273, no. 42). — P. 27593—27601. — doi:10.1074/jbc.273.42.27593. — PMID 9765293.
  20. ↑ Pan G., Aso T., Greenblatt J. Interaction of elongation factors TFIIS and elongin A with a human RNA polymerase II holoenzyme capable of promoter-specific initiation and responsive to transcriptional activators (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — September (vol. 272, no. 39). — P. 24563—24571. — doi:10.1074/jbc.272.39.24563. — PMID 9305922.
  21. ↑ Carty S.M., Goldstrohm A.C., Suñé C., Garcia-Blanco M.A., Greenleaf A.L. Protein-interaction modules that organize nuclear function: FF domains of CA150 bind the phosphoCTD of RNA polymerase II (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2000. — August (vol. 97, no. 16). — P. 9015—9020. — doi:10.1073/pnas.160266597. — PMID 10908677. — PMC 16813.
  22. ↑ Grondin B., Côté F., Bazinet M., Vincent M., Aubry M. Direct interaction of the KRAB/Cys2-His2 zinc finger protein ZNF74 with a hyperphosphorylated form of the RNA polymerase II largest subunit (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — October (vol. 272, no. 44). — P. 27877—27885. — doi:10.1074/jbc.272.44.27877. — PMID 9346935.

Литература править

Ссылки править

Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=POLR2A&oldid=110185079