POLR2F

Полипептид F РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
Полипептид F РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
	PDB rendering based on 1qkl.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
	Список идентификаторов PDB 1QKL
Идентификаторы
Символ	POLR2F ; HRBP14.4; POLRF; RPABC14.4; RPABC2; RPB14.4; RPB6; RPC15
Внешние ID	OMIM: 604414 MGI: 1349393 HomoloGene: 7178 GeneCards: Ген POLR2F
номер EC	2.7.7.6
Функция	• RNA polymerase I activity; • RNA polymerase II activity; • RNA polymerase III activity; • DNA binding;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleoplasm; • DNA-directed RNA polymerase II, core complex; • DNA-directed RNA polymerase III complex; • nucleolus; • DNA-directed RNA polymerase I complex; • cytosol;
Биологический процесс	• mRNA splicing, via spliceosome; • DNA repair; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • nucleotide-excision repair; • transcription from RNA polymerase I promoter; • transcription from RNA polymerase II promoter; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription from RNA polymerase III promoter; • transcription elongation from RNA polymerase III promoter; • termination of RNA polymerase III transcription; • RNA splicing; • gene expression; • viral process; • positive regulation of type I interferon production; • innate immune response; • positive regulation of viral transcription;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Субъединица RPABC2 ДНК-управляемой РНК-полимеразы I, II и III — белок, кодируемый у человека, геном POLR2F .^[1]

Этот ген кодирует шестую по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез мессенджера РНК у эукариот, в котором также участвуют две других ДНК-управляемых РНК-полимеразы. У дрожжей, эта полимеразная субъединица, в комбинации по меньшей мере с двумя другими субъединицами, образует структуру, которая стабилизирует транскрипцию полимеразы в матрице ДНК.^[2]

Взаимодействия править

POLR2F, как было выявлено, взаимодействует с POLR2C.^[3]

Примечания править

↑ Pusch C., Wang Z., Roe B., Blin N. Genomic structure of the RNA polymerase II small subunit (hRPB14.4) locus (POLRF) and mapping to 22q13.1 by sequence identity (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1996. — September (vol. 34, no. 3). — P. 440—442. — doi:10.1006/geno.1996.0312. — PMID 8786150.
↑ Entrez Gene: POLR2F polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide F (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
↑ Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.

Литература править

Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription. (англ.) // J. Biomed. Sci.^[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation. (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
Romano G; Kasten M; De Falco G; Micheli, Pietro; Khalili, Kamel; Giordano, Antonio. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression (англ.) // J. Cell. Biochem.^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
Harrich D; McMillan N; Munoz L; Apolloni, Ann; Meredith, Luke. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
Kato H; Sumimoto H; Pognonec P; Chen, C H; Rosen, C A; Roeder, R G. HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1992. — Vol. 6, no. 4. — P. 655—666. — doi:10.1101/gad.6.4.655. — PMID 1559613.
Southgate C., Zapp M.L., Green M.R. Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 345, no. 6276. — P. 640—642. — doi:10.1038/345640a0. — PMID 2190099.
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 16. — P. 7153—7157. — doi:10.1073/pnas.92.16.7153. — PMID 7638159. — PMC 41297.
Acker J., Wintzerith M., Vigneron M., Kedinger C. A 14.4 KDa acidic subunit of human RNA polymerase II with a putative leucine-zipper (англ.) // DNA Seq. : journal. — 1995. — Vol. 4, no. 5. — P. 329—331. — doi:10.3109/10425179409020860. — PMID 7803819.
Herrmann C.H., Rice A.P. Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor (англ.) // J. Virol.^[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 69, no. 3. — P. 1612—1620. — PMID 7853496. — PMC 188757.
Keen N.J., Gait M.J., Karn J. Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 6. — P. 2505—2510. — doi:10.1073/pnas.93.6.2505. — PMID 8637904. — PMC 39827.
Yang X., Herrmann C.H., Rice A.P. The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function (англ.) // J. Virol.^[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 70, no. 7. — P. 4576—4584. — PMID 8676484. — PMC 190394.
Agostini I; Navarro JM; Rey F; Bouhamdan, M; Spire, B; Vigne, R; Sire, J. The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB (англ.) // J. Mol. Biol.^[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 261, no. 5. — P. 599—606. — doi:10.1006/jmbi.1996.0485. — PMID 8800208.
Zhou Q., Sharp P.A. Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 274, no. 5287. — P. 605—610. — doi:10.1126/science.274.5287.605. — PMID 8849451.
Okamoto H; Sheline CT; Corden JL; Jones, KA; Peterlin, B.M. Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 21. — P. 11575—11579. — doi:10.1073/pnas.93.21.11575. — PMID 8876177. — PMC 38099.
Chun R.F., Jeang K.T. Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 44. — P. 27888—27894. — doi:10.1074/jbc.271.44.27888. — PMID 8910388.
Parada C.A., Roeder R.G. Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-induced phosphorylation of its carboxy-terminal domain (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 384, no. 6607. — P. 375—378. — doi:10.1038/384375a0. — PMID 8934526.
García-Martínez L.F., Ivanov D., Gaynor R.B. Association of Tat with purified HIV-1 and HIV-2 transcription preinitiation complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 11. — P. 6951—6958. — doi:10.1074/jbc.272.11.6951. — PMID 9054383.

[pmid8786150-1] Pusch C., Wang Z., Roe B., Blin N. Genomic structure of the RNA polymerase II small subunit (hRPB14.4) locus (POLRF) and mapping to 22q13.1 by sequence identity (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1996. — September (vol. 34, no. 3). — P. 440—442. — doi:10.1006/geno.1996.0312. — PMID 8786150.

[2] Entrez Gene: POLR2F polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide F (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

[pmid9201987-3] Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.

[1]

[2]

[3]