XbaI
XbaI - эндонуклеаза рестрикции, выделенна из бактерии Xanthomonas badrii [1].
| XbaI | |
|---|---|
| Идентификаторы | |
| Шифр КФ | 3.1.21.4 |
| Базы ферментов | |
| IntEnz | IntEnz view |
| BRENDA | BRENDA entry |
| ExPASy | NiceZyme view |
| MetaCyc | metabolic pathway |
| KEGG | KEGG entry |
| PRIAM | profile |
| PDB structures | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
| Поиск | |
| PMC | статьи |
| PubMed | статьи |
| NCBI | NCBI proteins |
Свойства править
XbaI относится к эндонуклеазам рестрикции (Тип II, подтип P). То есть XbaI распознает палиндромную последовательность ДНК и осуществляет рестрикцию внутри палиндрома в фиксированной точке. В присутствии диметилсульфоксида (ДМСО) и при высоких концентрациях глицерина в среде XbaI теряет способность распознавать палиндром и осуществляет неспецифическую рестрикцию (звёздная активность) [источник не указан 2303 дня]. После рестрикции образуются липкие концы с выступами из четырёх оснований.
| Палиндромный участок | Продукты рестрикции |
|---|---|
5'-TCTAGA-3' 3'-AGATCT-5' |
5'-T CTAGA-3' 3'-AGATC T-5' |
XbaI рестриктазная активность ингибируется при метилировании аденина (DAM метилаза). Однако, рестриктазная активность сохраняется при метилировании цитозина (DCM- или CpG-метилазы) [источник не указан 2303 дня].
После завершения рестрикции ДНК, XbaI может быть инактивирована денатурацией нагреванием до 65°C в течение 20 минут [источник не указан 2303 дня].
Применение править
XbaI широко используется в молекулярно-биологических исследованиях. В частность XbaI применяется при клонировании специфических нуклеотидных последовательностей [2], при рестрикционном анализе.
Так например, XbaI использовалась при анализе полиморфизма рецептора эстрогена α[3] и липопротеина а (ApoB)[4].
Ссылки править
- ↑ Biolabs, New England XbaI | NEB. www.neb.com. Дата обращения: 8 мая 2016. Архивировано 3 февраля 2022 года.
- ↑ Principles and techniques of biochemistry and molecular biology. — 7th ed. — Cambridge, UK: Cambridge University Press, 2010. — xvi, 744 pages с. — ISBN 9780521516358.
- ↑ Hong Weng, Chao Zhang, Yuan-Yuan Hu, Rui-Xia Yuan, Hong-Xia Zuo. Association between Estrogen Receptor-αGene XbaI and PvuII Polymorphisms and Periodontitis Susceptibility: A Meta-Analysis (англ.) // Disease Markers. — 2015. — Vol. 2015. — P. 1–9. — ISSN 0278-0240. — doi:10.1155/2015/741972. Архивировано 12 января 2018 года.
- ↑ Wei Gu, Mingduo Zhang, Shaojun Wen. Association between the APOB XbaI and EcoRI polymorphisms and lipids in Chinese: a meta-analysis (англ.) // Lipids in Health and Disease. — 2015/12. — Т. 14, вып. 1. — С. 123. — ISSN 1476-511X. — doi:10.1186/s12944-015-0125-z. Архивировано 12 января 2018 года.