Генотипы вируса гепатита C
Вирус гепатита C подразделяется на 8 генотипов, а те, в свою очередь, на свыше 100 подтипов. Генотипы вируса гепатита С различаются между собой по вариабельности нуклеотидного уровня более чем на 30%; подтипы внутри генотипа вируса вариабельны между собой примерно на 15%.[1]
Все генотипы вируса способны приводить к циррозу и гепатоцеллюлярной карциноме, однако генотип 3 является фактором более быстрого прогрессирования заболевания.[2]
Географически наиболее распространены генотипы 1—4. В Северной Америке и Западной Европе наиболее распространён подтип 1a[3], охватывающий до 70% всех случаев. В Центральной и Восточной Европе наиболее распространён подтип 1b. На просторах бывшего СССР наибольшее распространение получили подтип 1b и генотип 3. Генотип 4 наиболее распространён на Ближнем Востоке и Африке: в Египте на него приходится до 90% всех инфекций.[4]
Наиболее сложны в лечении подтип 1a и генотип 3. Из-за большого генетического разнообразия генотипа 2, часто вступающего в рекомбинанты с другими генотипами, встречаются отдельные штаммы генотипа 2, более устойчивые к терапии.
Самым проработанным для лечения является подтип 1b.
Согласно проведённому эволюционному анализу, ближайший общий предок вируса генотипа 3a существовал приблизительно 200 лет назад.[5]
| Генотипы | Подмножества | Географическое распределение[6] |
|---|---|---|
| Генотип 1 | 1a, 1b... 1n — всего 13 поименованных и 7 безымянных подтипов | Северная Америка, Евразия, Центральная Африка |
| Генотип 2 | 2a, 2b... 2u —
всего 15 поименованных и 8 безымянных подтипов |
Западная Африка, Италия |
| Генотип 3 | 3a, 3b... 3k — всего 8 поименованных подтипов и 1 безымянный | Индостан, Юго-Восточная Азия, республики бывшего СССР |
| Генотип 4 | 4a, 4b... 4w — всего 18 поименованных и 10 безымянных подтипов | Центральная Африка, Египет |
| Генотип 5 | 5a | Южная Африка и Азия |
| Генотип 6 | 6a, 6b... 6xf — всего 29 поименованных подтипов и 21 безымянный | Юго-Восточная Азия |
| Генотип 7 | Демократическая республика Конго[7] | |
| Генотип 8 | Штат Пенджаб (Индия) | |
| Рекомбинантные генотипы | 1a/1c, 1b/1a, 2/5, 2b/1a, 2b/6w, 2k/1b, 4d/4a, 6n/6o и прочие[8] |
Методы определения править
Основные методы, используемые для диагностики генотипа HCV, являются следующие:
- Иммуноферментный анализ
- Полимеразная цепная реакция в реальном времени
- Рекомбинантный иммуноблот анализ
Ссылки править
- ↑ Identification of Novel HCV Genotype and Subtypes in Patients Treated with Sofosbuvir-Based Regimens. www.natap.org (8 ноября 2017). Дата обращения: 10 ноября 2017. Архивировано 10 ноября 2017 года.
- ↑ Генотип 3 гепатита С может являться фактором более быстрого прогрессирования фиброза печени. www.hv-info.ru (28 октября 2009). Дата обращения: 10 ноября 2017. Архивировано 20 октября 2017 года.
- ↑ Архивированная копия. Дата обращения: 11 апреля 2017. Архивировано 22 марта 2017 года.[уточнить дату]
- ↑ Nouroz, Faisal. An overview on hepatitis C virus genotypes and its control (англ.) // Egyptian Journal of Medical Human Genetics : journal. — 2015. — Vol. 16, no. 4. — P. 291—298. — doi:10.1016/j.ejmhg.2015.05.003.
- ↑ Akkarathamrongsin S, Hacharoen P, Tangkijvanich P, et al. Molecular epidemiology and genetic history of hepatitis C virus subtype 3a infection in Thailand. Intervirology 2013; 56: 284–94.
- ↑ A new insight into hepatitis C vaccine development (англ.) // Journal of Biomedicine & Biotechnology : journal. — 2010. — Vol. 2010. — P. 548280. — doi:10.1155/2010/548280. — PMID 20625493.
- ↑ Donald G. Murphy, Erwin Sablon, Jasmine Chamberland, Eric Fournier, Raymond Dandavino. Hepatitis C Virus Genotype 7, a New Genotype Originating from Central Africa (англ.) // Journal of Clinical Microbiology. — 2015-03-01. — Vol. 53, iss. 3. — P. 967—972. — ISSN 1098-660X 0095-1137, 1098-660X. — doi:10.1128/JCM.02831-14. Архивировано 27 мая 2018 года.
- ↑ Andrea Galli, Jens Bukh. Comparative analysis of the molecular mechanisms of recombination in hepatitis C virus (англ.) // Trends in Microbiology. — Cell Press, 2014-06-01. — Vol. 22, iss. 6. — P. 354—364. — ISSN 1878-4380 0966-842X, 1878-4380. — doi:10.1016/j.tim.2014.02.005.