Интеграза

Интеграза (IN) — фермент, катализирующий интеграцию (включение) ДНК вируса (ретровируса, в частности, ВИЧ[1][2]) в хромосому клетки-хозяина. Перед интеграцией линейные молекулы ДНК вируса сначала замыкаются в кольцо и затем уже встраиваются.

Цинк-связывающий домен интегразы
Структура N-концевого цинк-связывающего домена интегразы вируса hiv-1
Структура N-концевого цинк-связывающего домена интегразы вируса hiv-1
Идентификаторы
Символ Integrase Zn
Pfam PF02022
InterPro IPR003308
SCOP 1wjb
SUPERFAMILY 1wjb
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель
Commons-logo.svg Медиафайлы на Викискладе
Ядро интегразы
PDB 1c1a EBI.jpg
Идентификаторы
Символ rve
Pfam PF00665
Pfam clan CL0219
InterPro IPR001584
SCOP 2itg
SUPERFAMILY 2itg
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель
Commons-logo.svg Медиафайлы на Викискладе
ДНК-связывающий домен интегразы
PDB 1c1a EBI.jpg
Идентификаторы
Символ IN DBD C
Pfam PF00552
InterPro IPR001037
SCOP 1ihw
SUPERFAMILY 1ihw
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель
Commons-logo.svg Медиафайлы на Викискладе

Ретровирусные интегразы — ключевой компонент прединтеграционного комплекса (PIC).

Сходные ферменты фагов — phage integrase, например λ phage integrase (Int).

СтруктураПравить

Все ретровирусные интегразы состоят из трех канонических доменов:

  • N-концевой цинк-связывающий домен с мотивом HHCC (например, His12 His16 Cys40 Cys43 у ВИЧ-1);
  • каталитический домен (RNaseH);
  • C-концевой ДНК-связывающий домен (SH3).

Изучена структура доменов интеграз вирусов HIV-1, HIV-2, SIV, Rous Sarcoma Virus (RSV), первые результаты опубликованы в 1994 году. Имеются данные, свидетельствующие, что интеграза функционирует как тетрамер. Несколько белков клетки взаимодействуют с интегразой, в частности, человеческий хроматин-ассоциированный LEDGF.

Интеграза ВИЧПравить

Вирус иммунодефицита человека содержит интегразу размером 32 кДа в гене Pol. Данный фермент является перспективной целью для ВААРТ. Используется 3 препарата, являющихся ингибиторами интегразы ВИЧ: Ралтегравир (RAL, Исентресс, с 2007 года), Долутегравир (DTG, Тивикай), Элвитегравир (EVG, с 2012 года)[3]

ПримечанияПравить

  1. HIV Integrase, a Brief Overview from Chemistry to Therapeutics
  2. СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ ИНТЕГРАЗЫ ВИЧ-1 Архивная копия от 1 октября 2008 на Wayback Machine, Успехи биологической химии, т. 45, 2005, с. 87—122
  3. HIV Integrase Inhibitors: 20-Year Landmark and Challenges / Adv Pharmacol. 2013;67:75-105. ISSN 1054-3589, doi:10.1016/B978-0-12-405880-4.00003-2 PMID 23885999.

СсылкиПравить