Обсуждение:Последовательность Шайна — Дальгарно

Последовательности нуклеотидов Шайна-Дальгарно и Козак

Обе статьи Консенсусная последовательность Козак и Последовательность Шайна-Дальгарно являются переводами соответствующих статей из английской вики, соответственно цитата из «первоисточника» The eukaryotic equivalent of the Shine-Dalgarno sequence is called the Kozak sequence (вполне осознаю, что статья в английской вики не является ВП:АИ)

Читаем в Последовательность Шайна-Дальгарно — является сайтом связывания рибосом на молекуле мРНК, обычно на расстоянии 16 нуклеотидов до стартового кодона AUG у прокариот… помогает рибосоме присоединиться к стартовому кодону молекулы мРНК для начала биосинтеза белка. Комплементарная последовательность… располагается на 3'-конце молекулы 16S рибосомной РНК.

Читаем в Консенсусная последовательность Козак — участок молекулы мРНК в районе стартового кодона… распознается рибосомой и требуется для инициации трансляции… не является сайтом связывания рибосомы

С точки зрения сайта связывания рибосомы, Ш-Д и Козак не одно и то же, но с точки зрения инициации трансляции (начала биосинтеза белка) — вполне аналогичны. Вероятно, следует добавить еще одну метафору, — последовательности Ш-Д и Козак — аналогичны друг другу, но ни в коем случае не гомологичны и не ортологичны. --Sirozha.ru 08:52, 7 марта 2010 (UTC)

• Вот именно то, что последовательность Козак не является сайтом связывания рибосомы, и исключает какую-либо функциональную аналогию с точки зрения инициации трансляции. Alexey Karetnikov 17:14, 7 марта 2010 (UTC)
  • Это последовательность нуклеотидов в составе мРНК, которая требуется или облегчает инициацию трансляции. Посмотрю, что по этому поводу думают авторы учебников по молекулярной биологии. На мой взгляд, функциональная аналогия более чем очевидна --Sirozha.ru 17:20, 7 марта 2010 (UTC)
    • Для инициации трансляции много что требуется - много разных элементов. Но это вовсе не обязательно означает, что все эти элементы функционально аналогичны друг другу, ибо используемые механизмы могут быть совершенно различны. В данном случае, механизмы инициации фундаментально различаются. Поэтому ни о какой функциональной аналогии речи быть не может. Alexey Karetnikov 17:25, 7 марта 2010 (UTC)
• Консервативная у многих прокариот последовательность нуклеотидов Шайна-Дальгарно, и консервативная у многих эукариот последовательность Козак располагаются в области 5-конца мРНК и принимают участие в процессах инициации трансляции. Данные последовательности выполняют разные функции, вероятно, совершенно разные. Однако сам факт наличия в районе 5-конца мРНК консервативных последовательностей, принимающих участие в процессе трансляции у прокариот и эукариот делает логичным упоминание этих статей взаимно в разделе "См. также". --Sirozha.ru 04:07, 8 марта 2010 (UTC)
  • Не возражаю против раздела См. также. Alexey Karetnikov 04:13, 8 марта 2010 (UTC)
    • Имею как минимум три источника, в которых последовательности Козак и Шайна-Дальгарно упоминаются в пределах одного раздела, это учебник Lodish, и два авторитетных интернет-ресурса первый и второй. Про функциональную аналогию этих последовательностей нигде в литературе не говорится. --Sirozha.ru 04:30, 8 марта 2010 (UTC)
      • Замечательно! Но я уже сказал, что не возражаю против раздела См. также. А функциональной аналогии здесь нет. Alexey Karetnikov 04:34, 8 марта 2010 (UTC)