Пэннинг

Пэннинг (англ. panning, biopanning) — метод молекулярной биологии для отбора из большого количества сходных биообъектов (пептидов, белков, фагов), названный так по аналогии с промывкой золотоносного песка в лотке (англ. panning), где биообъекты «просеивают» на сорбенте или подложке, содержащих иммобилизованный лиганд. Часто используют для отбора из библиотек биомолекул, которые могут содержать огромное их разнообразие, порядка 10¹⁰ различных видов молекул в библиотеке.

Описание

Типичным примером является иммобилизация антигена на планшете, гранулах и т. п. с последующим добавлением фаговой библиотеки антител и связыванием специфичных антител с антигеном и дальнейшей отмывкой и элюцией специфичных молекул.

В настоящее время существует несколько разновидностей пэннинга: классический пэннинг на подложке, пэннинг в растворе и клеточный пэннинг. Пример пэннинга на подложке описан выше. При пэннинге в растворе сначала в растворе проводят взаимодействие специфичные молекул с лигандом, а потом проводят осаждение образовавшихся комплексов. При клеточном пэннинге в качестве подложки используют клетки, которые нагружают лигандом, с которым затем связывается специфичные молекулы. Затем проводят выделение клеток со связавшимися молекулами и выделение специфичных молекул. Последние два метода используют для того, чтобы избежать конформационных модификаций молекул лигандов при иммобилизации их на подложке.