Ойген Шоберт родился в [[ВольфсбургВюрцбург|Вюрцбурге]]е в [[Королевство Бавария|Королевстве Бавария]], части [[Германская империя|Германской империи]].<ref name="Virtuti Pro Patria, 404">''Virtuti Pro Patria'', 404</ref>. Сын майора Карла Шоберта и Анны Шоберт ([[Девичья фамилия|урождённой]] Михайли).<ref name="Virtuti Pro Patria, 404"/> Шоберт вступил в Королевскую армию Баварии в июле 1902 г. Начал службу в 1-м баварском пехотном полку «Кёниг» ([[немецкий язык|нем.]]"König"). Прошел летное обучение в 1911 г.<ref name="Virtuti Pro Patria, 404"/>