Гистоны: различия между версиями

[отпатрулированная версия][непроверенная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Спасено источников — 1, отмечено мёртвыми — 0. Сообщить об ошибке. См. FAQ. Внимание: согласно обсуждению бот больше не будет оставлять сообщений на СО. #IABot (v2.0beta9)
оформление
Строка 1:
[[Файл:Nucleosome structure-3 ru.png|thumb|300px|Образование нуклеосомы]]
[[Файл:Histone handshake.png|thumb|200px|«Рукопожатие» гистонов]]
[[Файл:PDB 1hst EBI.jpg|thumb|200px|Линкерный гистон H5: вид в двух проекциях]]
[[Файл:Nucleosome-ru.jpg|thumb|200px|Схематическое изображение структуры нуклеосомы]]
'''Гисто́ны''' — обширный класс ядерных [[Белки|белков]], выполняющих две основные функции: они участвуют в упаковке нитей [[ДНК]] в ядре и в [[эпигенетическое наследование|эпигенетической]] регуляции таких ядерных процессов, как [[транскрипция (биология)|транскрипция]], [[репликация ДНК|репликация]] и [[Репарация ДНК|репарация]]. Существует пять различных типов гистонов H1/Н5, H2A, H2B, H3, H4. Гистоны H2A, H2B, H3, H4, называемые ''кóровыми'' гистонами (от {{lang-en|core}} — сердцевина), формируют [[Нуклеосома|нуклеосому]], представляющую собой белковую глобулу, вокруг которой накручена нить ДНК. Гистон H1/H5, называемый ''линкерным'' гистоном (от {{lang-en|link}} — связь), связывается с внешней стороной нуклеосомы, фиксируя на ней нить ДНК. В [[хроматин]]е гистоны составляют 25—40 % сухого веса<ref name="Slov">{{книга|автор= |часть= |ссылка часть= |заглавие=Биологический энциклопедический словарь |оригинал= |ссылка= |викитека= |ответственный=Гл.ред. М.С.Гиляров |издание= |место=М. |издательство=Сов. энциклопедия |год= 1986|том= |страницы= |страниц=831 |серия= |isbn= |тираж=}}</ref>. Благодаря высокому содержанию [[лизин]]а и [[аргинин]]а гистоны проявляют сильно оснóвные свойства. Гистоны непосредственно контактируют с ДНК и способны нейтрализовать отрицательный заряд фосфатных групп ДНК за счёт положительных зарядов аминокислотных остатков. Последовательность [[Аминокислоты|аминокислот]] в этих белках является консервативной и практически не различается в организмах различных [[таксон]]ов. Гистоны присутствуют в ядрах [[Эукариоты|эукариотических]] клеток; у [[Бактерии|бактерий]] гистонов нет, но они выявлены у [[Археи|архей]] группы ''Euryarchaea''<ref name="App">{{книга |автор= |часть= |ссылка часть= |заглавие= Нуклеиновые кислоты: от А до Я|оригинал= |ссылка= |викитека= |ответственный= Б. Аппель [и др.]|издание= |место= М.|издательство=Бином: Лаборатория знаний |год= 2013|том= |страницы= |столбцы= |страниц=413 |серия= |isbn=978-5-9963-0376-2 |тираж=700}}</ref>.
 
Строка 8 ⟶ 5 :
 
== Структура нуклеосомы и гистоновых белков ==
[[Файл:Nucleosome-ru.jpg|thumb|200px|Схематическое изображение структуры нуклеосомы]]
По две молекулы каждого из гистонов Н2А, Н2В, Н3 и Н4 составляют октамер, обвитый сегментом ДНК длиной 146 пар оснований (п.о.), образующим 1,8 витка спирали поверх белковой структуры. Эта частица диаметром 7 нм называется [[нуклеосома|нуклеосомой]]. Участок ДНК, соединяющий соседние нуклеосомы и непосредственно не контактирующий с гистоновым октамером, взаимодействует с линкерным гистоном Н1. <!--Этот белок закрывает примерно 20 п.о. и обеспечивает формирование суперспиральной структуры (соленоида) диаметром 30 нм. Когда хроматин конденсируется с образованием метафазной хромосомы, соленоидные структуры образуют петли диаметром 200 нм, содержащие ДНК длиной 80000 п.о. Петли связаны с остовом из белков (ядерный остов), причём примерно 20 петель образуют минидиски. Большое число минидисков укладывается в стопку, составляя хромосому. Вследствие этого ДНК оказывается свернута настолько плотно, что даже самая маленькая хромосома человека содержит около 50 млн п.о.--> Длина фрагмента ДНК, приходящегося на одну нуклеосому, варьирует и составляет в среднем 200 п.о. При этом непосредственно с нуклеосомой связаны 146 п.о., а остальные несколько десятков соединяют две соседние нуклеосомы<ref name="Коряков">{{статья |автор=Коряков Д. Е. |заглавие=Модификации гистонов и регуляция работы хроматина |оригинал= |ссылка= |автор издания= |издание= Генетика|тип= |место= |издательство= |год=2006 |выпуск= |том=42|номер=9 |страницы= 1170-1185|isbn= |issn= |doi= |bibcode= |arxiv= |pmid= |язык= |ref= |archiveurl= |archivedate=}}</ref>.
 
Строка 13 ⟶ 11 :
 
=== Структура кóровых гистонов ===
Кóровые гистоны Н2А, Н2В, Н3 и Н4 являются небольшими белками с молекулярными массами 10—15 [[дальтон (единица измерения)|кДа]], состав которых чрезвычайно обогащён положительно заряженными аминокислотами [[лизин]]ом и [[аргинин]]ом<ref name="Разин" />. Положительно заряженные аминокислоты сосредоточены в основном в [[Аминогруппа|аминных]] (N-) и [[Карбоксильная группа|карбоксильных]] (C-) (см. [[Пептидная связь]]) концевых частях молекул коровых гистонов, называемых хвостами. Гистоновые хвосты длиной около 15—30 аминокислотных остатков не организованы в какие-либо выраженные вторичные структуры. Гистоновые хвосты, прежде всего N-хвост, играют ключевую роль в эпигенетических механизмах, в которых участвуют эти белки. В центральных, самых консервативных, участках полипептидной цепи кóровых гистонов преобладают остатки гидрофобных аминокислот. Именно эти центральные области участвуют в образовании нуклеосомного октамера, на который навивается ДНК<ref name="Карпов" />. Центральная область всех нуклеосомных гистонов имеет характерную вторичную структуру с протяжённым α-спиральным доменом, который с обеих сторон фланкируется доменами, содержащими по одной петле и по одной короткой α-спирали. Эта пространственная структура называется ''гистоновой складкой'' ({{lang-en|histone fold domain}}, HFD)<ref name="Коряков2">{{книга |автор= Коряков Д. Е.|часть= Нуклеосомная организация хроматина|ссылка часть= |заглавие=Эпигенетика |оригинал= |ссылка= |викитека= |ответственный= С. М. Закиян, В.В. Власов, Е. В. Дементьева|издание= |место= Новосибирск|издательство= Изд-во СО РАН|год=2012 |том= |страницы= 7—30|столбцы= |страниц= 592|серия= |isbn=978-5-7692-1227-7 |тираж=300 |ref= }}</ref>. Таким образом, нуклеосомные гистоны содержат центральный структурированный трехспиральный HFD-домен и неструктурированные N- и C-хвосты.
 
Кóровые гистоны Н2А, Н2В, Н3 и Н4 являются небольшими белками с молекулярными массами 10—15 [[дальтон (единица измерения)|кДа]], состав которых чрезвычайно обогащён положительно заряженными аминокислотами [[лизин]]ом и [[аргинин]]ом<ref name="Разин" />. Положительно заряженные аминокислоты сосредоточены в основном в [[Аминогруппа|аминных]] (N-) и [[Карбоксильная группа|карбоксильных]] (C-) (см. [[Пептидная связь]]) концевых частях молекул коровых гистонов, называемых хвостами. Гистоновые хвосты длиной около 15—30 аминокислотных остатков не организованы в какие-либо выраженные вторичные структуры. Гистоновые хвосты, прежде всего N-хвост, играют ключевую роль в эпигенетических механизмах, в которых участвуют эти белки. В центральных, самых консервативных, участках полипептидной цепи кóровых гистонов преобладают остатки гидрофобных аминокислот. Именно эти центральные области участвуют в образовании нуклеосомного октамера, на который навивается ДНК<ref name="Карпов" />. Центральная область всех нуклеосомных гистонов имеет характерную вторичную структуру с протяжённым α-спиральным доменом, который с обеих сторон фланкируется доменами, содержащими по одной петле и по одной короткой α-спирали. Эта пространственная структура называется ''гистоновой складкой'' ({{lang-en|histone fold domain}}, HFD)<ref name="Коряков2">{{книга |автор= Коряков Д. Е.|часть= Нуклеосомная организация хроматина|ссылка часть= |заглавие=Эпигенетика |оригинал= |ссылка= |викитека= |ответственный= С. М. Закиян, В.В. Власов, Е. В. Дементьева|издание= |место= Новосибирск|издательство= Изд-во СО РАН|год=2012 |том= |страницы= 7—30|столбцы= |страниц= 592|серия= |isbn=978-5-7692-1227-7 |тираж=300 |ref= }}</ref>. Таким образом, нуклеосомные гистоны содержат центральный структурированный трехспиральный HFD-домен и неструктурированные N- и C-хвосты.
[[Файл:Histone handshake.png|thumb|200px|«Рукопожатие» гистонов]]
Гистоны H3 и H4, Н2А и H2B попарно узнают друг друга. Спиральные домены взаимодействуют между собой, образуя структуры, названные рукопожатием, в результате чего возникают гетеродимеры — Н3-Н4 и Н2А-Н2В. Из первого димера, в свою очередь, образуется тетрамер (Н3-Н4)<sub>2</sub>. Тетрамер (Н3-Н4)<sub>2</sub> и два димера Н2А-Н2В составляют гистоновый октамер, сердцевину нуклеосомы<ref name="Карпов" />. Нуклеосома имеет клиновидную форму. Её узкую часть составляет (Н3-Н4)<sub>2</sub>, а широкая часть состоит из двух димеров Н2А-Н2В, которые расположены по бокам тетрамера (Н3-Н4)<sub>2</sub> и не взаимодействуют друг с другом. Из всей ДНК, что намотана на нуклеосомный октамер, примерно 80 пар оснований связаны с тетрамером (Н3-Н4)<sub>2</sub> и около 40 пар с димерами Н2А-Н2В<ref name="Коряков2" />.
 
=== Структура линкерного гистона H1/Н5 ===
[[Файл:PDB 1hst EBI.jpg|thumb|200px|Линкерный гистон H5: вид в двух проекциях]]
С внешней стороной нуклеосомы в районе тетрамера (Н3-Н4)<sub>2</sub> связывается линкерный гистон H1, фиксирующий тем самым на нуклеосоме нить ДНК. В [[эритроцит]]ах птиц и рептилий в неактивном хроматине вместо гистона Н1 присутствует близкородственный гистон Н5<ref name="Коряков2" />. Гистон Н1/Н5 существенно отличается от четырёх коровых гистонов. Он имеет молекулярную массу более 20 кДа. В его составе значительно больше остатков лизина, чем аргинина, причём все положительно заряженные аминокислотные остатки сконцентрированы на С-конце молекулы Н1. С-конец молекулы Н1 характеризуется неупорядоченной структурой и имеет длину около 100 аминокислотных остатков. Центральная часть молекулы Н1 богата гидрофобными аминокислотными остатками и в растворе образует глобулу. N-конец не имеет упорядоченной структуры и является относительно коротким<ref name="Разин">{{книга |автор= Разин С. В.|заглавие= Хроматин: упакованный геном|ответственный=С. В. Разин, А. А. Быстрицкий |ссылка= |место=М. |издательство= БИНОМ: Лаборатория знаний|год=2009 |том= |страниц= 176|страницы= 4-8|isbn=978-5-9963-0087-7|ref = }}</ref>.