Сродство (биохимия)

В биохимии cродство (также аффинность связывания) является мерой тенденции молекул к связыванию с другими молекулами, например между партнерами по связыванию при взаимодействии белок-лиганд: чем выше аффинность, тем больше константа ассоциации K_a (также называемая константой связывания).

Характеристики

Однако в настоящее время вместо константы ассоциации обычно используют обратную меру — константу диссоциации K_d : чем выше сродство белка к своему лиганду, тем ниже константа диссоциации комплекса. На примере образования/расщепления фермент-субстратного комплекса [ЭС].

определения согласно закону действующих масс или кинетическим константам (константам скорости k) перечислены здесь:

константа ассоциации(константа связывания)	$K_{a}={[ES] \over [E]\cdot [S]}$	$K_{a}={k_{1} \over k'_{1}}$
константа диссоциации	$K_{d}={[E]\cdot [S] \over [ES]}$	$K_{d}={k'_{1} \over k_{1}}$ .

В кинетике ферментов K_m, константа Михаэлиса, иногда используется как мера сродства фермента к его субстрату. На практике это имеет определённое право, но теоретически константу диссоциации ЭС-комплекса K_d и константу Михаэлиса необходимо строго различать. Согласно Бриггсу и Холдейну, постоянная Михаэлиса также зависит от числа изменений k₂ и рассчитывается следующим образом:

$K_{m}={k'_{1}+k_{2} \over k_{1}}$ .

Вывод из K_m в K_d возможен только в том случае, если $k_{2}\ll k'_{1}$ . Это предположение подходит не во всех случаях, но первоначально было сделано Леонор Михаэлис и Мод Ментен для вывода уравнения Михаэлиса-Ментен.

Аффинность можно определить с помощью анализа связывания лиганда.

См. также

• Сродство (химия)
• Аффинная хроматография
• Авидность

Литература

• Джереми М. Берг, Джон Л. Тимочко, Люберт Страйер : биохимия. 6-е издание, академическое издательство «Спектр», Гейдельберг, 2007 г. ISBN 978-3-8274-1800-5 .
• Дональд Воет, Джудит Г. Воет: Биохимия. 3. Издание, John Wiley & Sons, Нью-Йорк, 2004 г. ISBN 0-471-19350-X .
• Брюс Альбертс, Александр Джонсон, Питер Уолтер, Джулиан Льюис, Мартин Рафф, Кит Робертс: Молекулярная биология клетки, 5. Издание, Тейлор и Фрэнсис, 2007 г., ISBN 978-0-8153-4106-2 .