Википедия

Цинковый палец и BTB-домен, содержащий белок 16

Белок 16, содержащий цинковый палец и ВТВ-домен  — белок, кодируемый у человека геном ZBTB16 .

Цинковый палец и домен BTB содержащий 16
PDB представлено на примере 1buo.PDB представлено на примере 1buo.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1BUO, 1CS3

Идентификаторы
Символ ZBTB16 ; PLZF; ZNF145
Внешние ID OMIM: 176797 MGI: 103222 HomoloGene: 21214 GeneCards: Ген ZBTB16
Генная онтология
Функция • DNA binding

• double-stranded DNA binding
• sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• protein binding
• protein C-terminus binding
• protein domain specific binding
• identical protein binding
• protein homodimerization activity

• metal ion binding
Компонент клетки • nucleus

• cytosol
• plasma membrane
• nuclear body
• PML body
• nuclear speck

• transcriptional repressor complex
Биологический процесс • mesonephros development

• transcription, DNA-templated
• apoptotic process
• central nervous system development
• negative regulation of cell proliferation
• embryonic pattern specification
• anterior/posterior pattern specification
• protein ubiquitination
• hemopoiesis
• myeloid cell differentiation
• positive regulation of chondrocyte differentiation
• protein localization to nucleus
• embryonic hindlimb morphogenesis
• forelimb morphogenesis
• embryonic digit morphogenesis
• positive regulation of apoptotic process
• positive regulation of fat cell differentiation
• negative regulation of myeloid cell differentiation
• positive regulation of ossification
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• positive regulation of transcription, DNA-templated
• male germ-line stem cell asymmetric division
• cartilage development

• positive regulation of cartilage development
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 7704 235320
Ensembl ENSG00000109906 ENSMUSG00000066687
UniProt Q05516 A3KMN0
RefSeq (мРНК) NM_001018011 NM_001033324
RefSeq (белок) NP_001018011 NP_001028496
Локус (UCSC) Chr 11:
113.93 – 114.12 Mb		 Chr 9:
48.65 – 48.84 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Функция править

Этот ген — член семейства круппель-белков цинкового пальца типа C2H2 и кодирует транскрипционный фактор цинкового пальца, который содержит девять доменов типа круппель (нем. Krueppel) цинкового пальца на С-конце. Этот белок находится в ядре, участвует в прогрессировании клеточного цикла и взаимодействует с гистондезацетилазой. Конкретные случаи аберрантных перестроек генов в этом локусе были связаны с острым промиелоцитарным лейкозом[1] и физиологические функции были определены у мышей в качестве естественных киллеров Т-клеток[2][3] и гамма-дельта Т-клеток.[4] Существуют альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, которые были охарактеризованы у человека.[5][6]

Взаимодействия править

Белок 16, содержащий цинковый палец и ВТВ-домен, как было выявлено, взаимодействует со следующими структурами:

Примечания править

  1. ↑ Chen Z., Brand N.J., Chen A., Chen S.J., Tong J.H., Wang Z.Y., Waxman S., Zelent A. Fusion between a novel Krüppel-like zinc finger gene and the retinoic acid receptor-alpha locus due to a variant t(11;17) translocation associated with acute promyelocytic leukaemia (англ.) // The EMBO Journal[англ.] : journal. — 1993. — Vol. 12, no. 3. — P. 1161—1167. — PMID 8384553. — PMC 413318.
  2. ↑ Kovalovsky D., Uche O.U., Eladad S., Hobbs R.M., Yi W., Alonzo E., Chua K., Eidson M., Kim H.J., Im J.S., Pandolfi P.P., Sant'Angelo D.B. The BTB-zinc finger transcriptional regulator, PLZF, controls the development of iNKT cell effector functions (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2008. — Vol. 9, no. 9. — P. 1055—1064. — doi:10.1038/ni.1641. — PMID 18660811. — PMC 2662733.
  3. ↑ Savage A.K., Constantinides M.G., Han J., Picard D., Martin E., Li B., Lantz O., Bendelac A. The transcription factor PLZF (Zbtb16) directs the effector program of the NKT cell lineage (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2008. — Vol. 29, no. 3. — P. 391—403. — doi:10.1016/j.immuni.2008.07.011. — PMID 18703361. — PMC 2613001.
  4. ↑ Kreslavsky T., Savage A.K., Hobbs R., Gounari F., Bronson R., Pereira P., Pandolfi P.P., Bendelac A., von Boehmer H. TCR-inducible PLZF transcription factor required for innate phenotype of a subset of γδ T cells with restricted TCR diversity (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2009. — Vol. 106, no. 30. — P. 12453—12458. — doi:10.1073/pnas.0903895106. — PMID 19617548. — PMC 2718370.
  5. ↑ Zhang T., Xiong H., Kan L.X., Zhang C.K., Jiao X.F., Fu G., Zhang Q.H., Lu L., Tong J.H., Gu B.W., Yu M., Liu J.X., Licht J., Waxman S., Zelent A., Chen E., Chen S.J. Genomic sequence, structural organization, molecular evolution, and aberrant rearrangement of promyelocytic leukemia zinc finger gene (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 20. — P. 11422—11427. — doi:10.1073/pnas.96.20.11422. — PMID 10500192. — PMC 18049. Архивировано 24 сентября 2015 года.
  6. ↑ ZBTB16 zinc finger and BTB domain containing 16. Entrez (4 октября 2009). Дата обращения: 10 октября 2009.
  7. ↑ Senbonmatsu T., Saito T., Landon E.J., Watanabe O., Price E., Roberts R.L., Imboden H., Fitzgerald T.G., Gaffney F.A., Inagami T. A novel angiotensin II type 2 receptor signaling pathway: possible role in cardiac hypertrophy (англ.) // EMBO J.[англ.] : journal. — Vol. 22, no. 24. — P. 6471—6482. — doi:10.1093/emboj/cdg637. — PMID 14657020. — PMC 291832.
  8. ↑ Dhordain P., Albagli O., Honore N., Guidez F., Lantoine D., Schmid M., The H.D., Zelent A., Koken M.H. Colocalization and heteromerization between the two human oncogene POZ/zinc finger proteins, LAZ3 (BCL6) and PLZF (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — Vol. 19, no. 54. — P. 6240—6250. — doi:10.1038/sj.onc.1203976. — PMID 11175338.
  9. ↑ Barna M., Merghoub T., Costoya J.A., Ruggero D., Branford M., Bergia A., Samori B., Pandolfi P.P. Plzf mediates transcriptional repression of HoxD gene expression through chromatin remodeling (англ.) // Dev. Cell[англ.] : journal. — Vol. 3, no. 4. — P. 499—510. — doi:10.1016/s1534-5807(02)00289-7. — PMID 12408802.
  10. ↑ 1 2 Ward J.O., McConnell M.J., Carlile G.W., Pandolfi P.P., Licht J.D., Freedman L.P. The acute promyelocytic leukemia-associated protein, promyelocytic leukemia zinc finger, regulates 1,25-dihydroxyvitamin D(3)-induced monocytic differentiation of U937 cells through a physical interaction with vitamin D(3) receptor (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.]. — Vol. 98, no. 12. — P. 3290—3300. — doi:10.1182/blood.v98.12.3290. — PMID 11719366.
  11. ↑ Puccetti E., Obradovic D., Beissert T., Bianchini A., Washburn B., Chiaradonna F., Boehrer S., Hoelzer D., Ottmann O.G., Pelicci P.G., Nervi C., Ruthardt M. AML-associated translocation products block vitamin D(3)-induced differentiation by sequestering the vitamin D(3) receptor (англ.) // Cancer Research[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research[англ.]. — Vol. 62, no. 23. — P. 7050—7058. — PMID 12460926.
  12. ↑ McLoughlin P., Ehler E., Carlile G., Licht J.D., Schäfer B.W. The LIM-only protein DRAL/FHL2 interacts with and is a corepressor for the promyelocytic leukemia zinc finger protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277, no. 40. — P. 37045—37053. — doi:10.1074/jbc.M203336200. — PMID 12145280.
  13. ↑ Labbaye C., Quaranta M.T., Pagliuca A., Militi S., Licht J.D., Testa U., Peschle C. PLZF induces megakaryocytic development, activates Tpo receptor expression and interacts with GATA1 protein (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — Vol. 21, no. 43. — P. 6669—6679. — doi:10.1038/sj.onc.1205884. — PMID 12242665.
  14. ↑ Tsuzuki S., Enver T. Interactions of GATA-2 with the promyelocytic leukemia zinc finger (PLZF) protein, its homologue FAZF, and the t(11;17)-generated PLZF-retinoic acid receptor alpha oncoprotein (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.]. — Vol. 99, no. 9. — P. 3404—3410. — doi:10.1182/blood.v99.9.3404. — PMID 11964310.
  15. ↑ 1 2 3 4 Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard L.L., Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 mediates transcriptional repression by the acute promyelocytic leukaemia-associated protein PLZF (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — Vol. 23, no. 54. — P. 8777—8784. — doi:10.1038/sj.onc.1208128. — PMID 15467736.
  16. ↑ 1 2 3 David G., Alland L., Hong S.H., Wong C.W., DePinho R.A., Dejean A. Histone deacetylase associated with mSin3A mediates repression by the acute promyelocytic leukemia-associated PLZF protein (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — Vol. 16, no. 19. — P. 2549—2556. — doi:10.1038/sj.onc.1202043. — PMID 9627120.
  17. ↑ 1 2 3 Wong C.W., Privalsky M.L. Components of the SMRT corepressor complex exhibit distinctive interactions with the POZ domain oncoproteins PLZF, PLZF-RARalpha, and BCL-6 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 273, no. 42. — P. 27695—27702. — doi:10.1074/jbc.273.42.27695. — PMID 9765306.
  18. ↑ 1 2 Lemercier C., Brocard M.P., Puvion-Dutilleul F., Kao H.Y., Albagli O., Khochbin S. Class II histone deacetylases are directly recruited by BCL6 transcriptional repressor (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277, no. 24. — P. 22045—22052. — doi:10.1074/jbc.M201736200. — PMID 11929873.
  19. ↑ Nanba D., Mammoto A., Hashimoto K., Higashiyama S. Proteolytic release of the carboxy-terminal fragment of proHB-EGF causes nuclear export of PLZF (англ.) // J. Cell Biol.[англ.] : journal. — Vol. 163, no. 3. — P. 489—502. — doi:10.1083/jcb.200303017. — PMID 14597771. — PMC 2173632.
  20. ↑ Nanba D., Toki F., Higashiyama S. Roles of charged amino acid residues in the cytoplasmic domain of proHB-EGF (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — Vol. 320, no. 2. — P. 376—382. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.05.176. — PMID 15219838.
  21. ↑ Takahashi S., McConnell M.J., Harigae H., Kaku M., Sasaki T., Melnick A.M., Licht J.D. The Flt3 internal tandem duplication mutant inhibits the function of transcriptional repressors by blocking interactions with SMRT (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.]. — Vol. 103, no. 12. — P. 4650—4658. — doi:10.1182/blood-2003-08-2759. — PMID 14982881.
  22. ↑ Hong S.H., David G., Wong C.W., Dejean A., Privalsky M.L. SMRT corepressor interacts with PLZF and with the PML-retinoic acid receptor alpha (RARalpha) and PLZF-RARalpha oncoproteins associated with acute promyelocytic leukemia (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — Vol. 94, no. 17. — P. 9028—9033. — doi:10.1073/pnas.94.17.9028. — PMID 9256429. — PMC 23013.
  23. ↑ Koken M.H., Reid A., Quignon F., Chelbi-Alix M.K., Davies J.M., Kabarowski J.H., Zhu J., Dong S., Chen S., Chen Z., Tan C.C., Licht J., Waxman S., de Thé H., Zelent A. Leukemia-associated retinoic acid receptor alpha fusion partners, PML and PLZF, heterodimerize and colocalize to nuclear bodies (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — Vol. 94, no. 19. — P. 10255—10260. — doi:10.1073/pnas.94.19.10255. — PMID 9294197. — PMC 23349.
  24. ↑ Melnick A.M., Westendorf J.J., Polinger A., Carlile G.W., Arai S., Ball H.J., Lutterbach B., Hiebert S.W., Licht J.D. The ETO protein disrupted in t(8;21)-associated acute myeloid leukemia is a corepressor for the promyelocytic leukemia zinc finger protein (англ.) // Mol. Cell. Biol.[англ.] : journal. — Vol. 20, no. 6. — P. 2075—2086. — doi:10.1128/mcb.20.6.2075-2086.2000. — PMID 10688654. — PMC 110824.
  25. ↑ Melnick A., Carlile G.W., McConnell M.J., Polinger A., Hiebert S.W., Licht J.D. AML-1/ETO fusion protein is a dominant negative inhibitor of transcriptional repression by the promyelocytic leukemia zinc finger protein (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.]. — Vol. 96, no. 12. — P. 3939—3947. — PMID 11090081.
  26. ↑ Martin P.J., Delmotte M.H., Formstecher P., Lefebvre P. PLZF is a negative regulator of retinoic acid receptor transcriptional activity (англ.) // Nucl. Recept. : journal. — Vol. 1, no. 1. — P. 6. — doi:10.1186/1478-1336-1-6. — PMID 14521715. — PMC 212040.
  27. ↑ Hoatlin M.E., Zhi Y., Ball H., Silvey K., Melnick A., Stone S., Arai S., Hawe N., Owen G., Zelent A., Licht J.D. A novel BTB/POZ transcriptional repressor protein interacts with the Fanconi anemia group C protein and PLZF (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.]. — Vol. 94, no. 11. — P. 3737—3747. — PMID 10572087.

Литература править

Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Цинковый_палец_и_BTB-домен,_содержащий_белок_16&oldid=137462516