Википедия

ARNT

(перенаправлено с «Ядерный транслокатор AHR»)

ARNT (сокр. от англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator) — ядерный транслокатор (переносчик) рецептора ароматических углеводородов (AHR), представляет собой белок, который образует комплекс с лиганд-связанным рецептором AHR и необходим для рецепторной функции. Кодируется одноимённым геном ARNT, локализован на коротком плече (p-плече) 1-хромосомы[5].

ARNT
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2K7S, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4LPZ, 4XT2

Идентификаторы
ПсевдонимыARNT, HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
Внешние IDOMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: ARNT
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме ARNT
Расположение в геноме ARNT
Локус1q21.3Начало150,809,713 bp[1]
Конец150,876,708 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
3-я хромосома мыши
Хр.3-я хромосома мыши[2]
3-я хромосома мыши
Расположение в геноме ARNT
Расположение в геноме ARNT
Локус3 F2.1|3 40.74 cMНачало95,341,699 bp[2]
Конец95,404,551 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • sural nerve

  • stromal cell of endometrium

  • popliteal artery
Наибольшая экспрессия в
  • cumulus cell
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

405

11863

Ensembl

ENSG00000143437

ENSMUSG00000015522

UniProt

P27540

P53762

RefSeq (мРНК)
NM_001197325
NM_001286035
NM_001286036
NM_001668
NM_178426

NM_178427
NM_001350224
NM_001350225
NM_001350226

NM_001037737
NM_009709

RefSeq (белок)
NP_001184254
NP_001272964
NP_001272965
NP_001659
NP_848514

NP_001337153
NP_001337154
NP_001337155

NP_001032826
NP_033839

Локус (UCSC)Chr 1: 150.81 – 150.88 MbChr 3: 95.34 – 95.4 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Закодированный белок также идентифицирован как бета-субъединица гетеродимерного транскрипционного фактора — фактора, индуцируемого гипоксией (HIF1β). Транслокация t(1; 12) (q21; p13), приводящая к слипанию с белком TEL-ARNT, связана с острым миелобластическим лейкозом. Для этого гена описаны три альтернативные сплайсированные варианты, кодирующие различные изоформы.

Рецептор ароматических углеводородов (АHR) участвует в индукции нескольких ферментов, которые участвуют в метаболизме ксенобиотиков. Лиганд-цитозольная форма рецептора ароматических углеводородов комплексно связана с белком теплового шока (Hsp90). Связывание лигандов, включаящие в себя диоксины (ТХДД) и полициклические ароматические углеводороды (ПАУ), приводит к транслокации (перемещению) лигандсвязывающей субъединицы только в[6] клеточное ядро. Индукция ферментов, участвующих в метаболизме ксенобиотиков, происходит за счёт связывания лиганд-связанного AhR с чувствительными к ксенобиотическими элементами в промоторных областях генов для этих ферментов.

Взаимодействия с другими белками править

ARNT взаимодействует со следующими белками:

Примечания править

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143437 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015522 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:700 (англ.). Дата обращения: 21 сентября 2017. Архивировано 21 сентября 2017 года.
  6. ↑ Hughes D., Guttenplan J. B., Marcus C. B., Subbaramaiah K., Dannenberg A. J. Heat Shock Protein 90 Inhibitors Suppress Aryl Hydrocarbon Receptor-Mediated Activation of CYP1A1 and CYP1B1 Transcription and DNA Adduct Formation (англ.) // Cancer Prevention Research. — 2008. — 1 November (vol. 1, no. 6). — P. 485—493. — ISSN 1940-6207. — doi:10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149. [исправить]
  7. ↑ Carver L.A., Bradfield C.A. Ligand-dependent interaction of the aryl hydrocarbon receptor with a novel immunophilin homolog in vivo (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — April (vol. 272, no. 17). — P. 11452—11456. — doi:10.1074/jbc.272.17.11452. — PMID 9111057.
  8. ↑ Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I. The hsp90 chaperone complex regulates intracellular localization of the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology  (англ.) (рус. : journal. — 2001. — April (vol. 21, no. 7). — P. 2594—2607. — doi:10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001. — PMID 11259606. — PMC 86890.
  9. ↑ Lindebro M.C., Poellinger L., Whitelaw M.L. Protein-protein interaction via PAS domains: role of the PAS domain in positive and negative regulation of the bHLH/PAS dioxin receptor-Arnt transcription factor complex (англ.) // The EMBO Journal  (англ.) (рус. : journal. — 1995. — July (vol. 14, no. 14). — P. 3528—3539. — PMID 7628454. — PMC 394421.
  10. ↑ Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson J.A., Poellinger L. Ligand-dependent recruitment of the Arnt coregulator determines DNA recognition by the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology  (англ.) (рус. : journal. — 1993. — April (vol. 13, no. 4). — P. 2504—2514. — PMID 8384309. — PMC 359572.
  11. ↑ Yamaguchi Y., Kuo M.T. Functional analysis of aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator interactions with aryl hydrocarbon receptor in the yeast two-hybrid system (англ.) // Biochemical Pharmacology  (англ.) (рус. : journal. — 1995. — October (vol. 50, no. 8). — P. 1295—1302. — doi:10.1016/0006-2952(95)02016-6. — PMID 7488247.
  12. ↑ Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Identification of a novel mechanism of regulation of Ah (dioxin) receptor function (англ.) // Genes & Development : journal. — 1999. — January (vol. 13, no. 1). — P. 20—5. — doi:10.1101/gad.13.1.20. — PMID 9887096. — PMC 316371.
  13. ↑ 1 2 Hogenesch J.B., Chan W.K., Jackiw V.H., Brown R.C., Gu Y.Z., Pray-Grant M., Perdew G.H., Bradfield C.A. Characterization of a subset of the basic-helix-loop-helix-PAS superfamily that interacts with components of the dioxin signaling pathway (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — March (vol. 272, no. 13). — P. 8581—8593. — doi:10.1074/jbc.272.13.8581. — PMID 9079689.
  14. ↑ 1 2 3 Woods S.L., Whitelaw M.L. Differential activities of murine single minded 1 (SIM1) and SIM2 on a hypoxic response element. Cross-talk between basic helix-loop-helix/per-Arnt-Sim homology transcription factors (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — March (vol. 277, no. 12). — P. 10236—10243. — doi:10.1074/jbc.M110752200. — PMID 11782478.
  15. ↑ 1 2 Beischlag T.V., Wang S., Rose D.W., Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson W.E., Probst M.R., Rosenfeld M.G., Hankinson O. Recruitment of the NCoA/SRC-1/p160 family of transcriptional coactivators by the aryl hydrocarbon receptor/aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology  (англ.) (рус. : journal. — 2002. — June (vol. 22, no. 12). — P. 4319—4333. — doi:10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002. — PMID 12024042. — PMC 133867.
  16. ↑ 1 2 Probst M.R., Fan C.M., Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Two murine homologs of the Drosophila single-minded protein that interact with the mouse aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — February (vol. 272, no. 7). — P. 4451—4457. — doi:10.1074/jbc.272.7.4451. — PMID 9020169.
  17. ↑ Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression (англ.) // Molecular and Cellular Biology  (англ.) (рус. : journal. — 2004. — January (vol. 24, no. 2). — P. 608—616. — doi:10.1128/mcb.24.2.608-616.2004. — PMID 14701734. — PMC 343817.
  18. ↑ Moffett P., Reece M., Pelletier J. The murine Sim-2 gene product inhibits transcription by active repression and functional interference (англ.) // Molecular and Cellular Biology  (англ.) (рус. : journal. — 1997. — September (vol. 17, no. 9). — P. 4933—4947. — doi:10.1128/mcb.17.9.4933. — PMID 9271372. — PMC 232345.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=ARNT&oldid=129982426