Открыть главное меню

Dicer

Dicer — рибонуклеаза из семейства РНКазы III (RNase III), которая разрезает двуцепочечные молекулы РНК и пре-микроРНК (pre-miRNA) с получением коротких двуцепочечных РНК-фрагментов, называемых малыми интерферирующими РНК (siRNA) и микроРНК (miRNA) соответственно. Данные фрагменты имеют длину приблизительно 20-25 нуклеотидов, обычно с оверхенгом в 2-3 нуклеотида на 3'-конце[1].

Dicer 1, рибонуклеаза III
Mouse dicer.jpg
Структура РНКазы IIIb и дцРНК-связывающего домена мыши (Dicer).
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволDICER1 ; DCR1; Dicer; HERNA; MNG1; RMSE2
Внешние IDOMIM: 606241 MGI2177178 HomoloGene13251 GeneCards: DICER1 Gene
номер EC3.1.26.3
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez23405192119
EnsemblENSG00000100697ENSMUSG00000041415
UniProtQ9UPY3Q8R418
RefSeq (мРНК)NM_001195573NM_148948
RefSeq (белок)NP_001182502NP_683750
Локус (UCSC)Chr 14:
95.55 – 95.62 Mb
Chr 12:
104.69 – 104.75 Mb
Поиск в PubMed[1][2]
Молекула Dicer-подобного белка из Giardia intestinalis. Dicer катализирует разрезание двуцепочечной РНК (dsRNA), при этом образуются малые интерферирующие РНК (siRNA). Домены РНКазы III показаны зеленым цветом, домен PAZ — желтым, домен платформы — красным, соединительная спираль — синим. Расстояние между доменами РНКазы III и PAZ определяется длиной соединительной петли и углом её наклона, что, по-видимому, определяет длину образующихся молекул siRNA[1].

Dicer содержит два домена RNase III и один домен PAZ. Расстояние между этими участками в молекуле определяется длиной и углом соединяющей петли и определяет длину образующейся siRNA. Dicer катализирует первую стадию в процессе РНК-интерференции и инициирует образование RISC (RNA-induced silencing complex), каталитический компонент которого, белок Argonaute, является эндонуклеазой, деградирующей мРНК, комплементарные ведущей цепи siRNA[2].

См. такжеПравить

ПримечанияПравить

  1. 1 2 Macrae I., Zhou K., Li F., Repic A., Brooks A., Cande W., Adams P., Doudna J. Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer (англ.) // Science : journal. — 2006. — Vol. 311, no. 5758. — P. 195—198. — DOI:10.1126/science.1121638. — PMID 16410517.
  2. Jaronczyk K., Carmichael J., Hobman T. Exploring the functions of RNA interference pathway proteins: some functions are more RISCy than others? (англ.) // Biochem J (англ.) : journal. — 2005. — Vol. 387, no. Pt 3. — P. 561—571. — DOI:10.1042/BJ20041822. — PMID 15845026.