Белки F-box — белки, в которых есть хотя бы один домен F-box. Первый обнаруженный F-box-белок был одним из трёх компонентов SCF-комплекса, осуществляющего убиквитинирование белков, которые после этого разрушаются в протеосоме. F-box также участвуют в таких процессах как передача сигнала и регуляция клеточного цикла[2]. У растений многие F-box-белки участвуют в регуляции экспрессии генов и сайленсинге генов путём РНК-интерференции с микроРНК[3]. В клетках человека, в условиях повышенного содержания железа, два атома железа стабилизируют F-Box-белок FBXL5. Образовавшийся комплекс опосредует убиквитинирование белка IRP2, что приводит к снижению уровня железа в клетке.
| Домен F-box | |
|---|---|
![Структура белкового комплекса Skp1-Skp2 (Skp2 содержит F-box)[1].](/wiki/%D0%A4%D0%B0%D0%B9%D0%BB:PDB_1fs2_EBI.jpg) Структура белкового комплекса Skp1-Skp2 (Skp2 содержит F-box)[1]. | |
| Идентификаторы | |
| Символ | F-box domain |
| Pfam | PF00646 |
| Pfam clan | CL0271 |
| InterPro | IPR001810 |
| SMART | SM00256 |
| PROSITE | PS50181 |
| SCOP | 1fs2 |
| SUPERFAMILY | 1fs2 |
| Доступные структуры белков | |
| Pfam | структуры |
| PDB | RCSB PDB; PDBe; PDBj |
| PDBsum | 3D-модель |
 Медиафайлы на Викискладе | |
Домен F-box — структурный мотив приблизительно из 50 аминокислот, который служит для взаимодействия с другими белками. Впервые его обнаружили в циклине F, откуда этот мотив и получил своё название. Мотив F-box непосредственно взаимодействует с белком SCF-комплекса Skp1[4], а F-box-домены обычно располагаются в белках в непосредственной близости от других мотивов для белок-белкового взаимодействия, таких как лейцин-обогащённые повторы и WD-повторы, которые, как полагают, осуществляют связывание белка-мишени, который убиквитинируется SCF-комплексом[5].
Примечания
править- ↑ Schulman B. A., Carrano A. C., Jeffrey P. D. et al. Insights into SCF ubiquitin ligases from the structure of the Skp1-Skp2 complex (англ.) // Nature : journal. — 2000. — November (vol. 408, no. 6810). — P. 381—386. — doi:10.1038/35042620. — PMID 11099048.
- ↑ Craig K. L., Tyers M. The F-box: a new motif for ubiquitin dependent proteolysis in cell cycle regulation and signal transduction (англ.) // Prog. Biophys. Mol. Biol. : journal. — 1999. — Vol. 72, no. 3. — P. 299—328. — doi:10.1016/S0079-6107(99)00010-3. — PMID 10581972.
- ↑ Jones-Rhoades M. W., Bartel D. P., Bartel B. MicroRNAS and their regulatory roles in plants (англ.) // Annu Rev Plant Biol : journal. — 2006. — Vol. 57. — P. 19—53. — doi:10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218. — PMID 16669754.
- ↑ Bai C., Sen P., Hofmann K., Ma L., Goebl M., Harper J. W., Elledge S. J. SKP1 connects cell cycle regulators to the ubiquitin proteolysis machinery through a novel motif, the F-box (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1996. — July (vol. 86, no. 2). — P. 263—274. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80098-7. — PMID 8706131.
- ↑ Kipreos E. T., Pagano M. The F-box protein family (англ.) // Genome Biol.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 1, no. 5. — P. REVIEWS3002. — doi:10.1186/gb-2000-1-5-reviews3002. — PMID 11178263. — PMC 138887.
Дальнейшее чтение
править- Ho M., Tsai P., Chien C. F-box proteins: the key to protein degradation. (англ.) // J Biomed Sci[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 13, no. 2. — P. 181—191. — doi:10.1007/s11373-005-9058-2. — PMID 16463014.