Ku — белок, связывающийся с двуцепочечными разрывами в структуре ДНК. Ku необходим для репарации ДНК по пути негомологичного соединения концов (NHEJ). Эволюционно Ku консервативен от бактерий до человека. Древний бактериальный Ku является гомодимером,[2] эукариотический гомолог Ku — гетеродимер, состоящий из двух полипептидов — Ku70 (продукт гена XRCC6) и Ku80 (закодирован геном XRCC5), молекулярная масса этих полипептидов составляет 70 и 80 кДа, соответственно. Субъединицы Ku образуют корзиноподобную структуру, закрепляющуюся на конце молекулы ДНК.[3] После связывания Ku может скользить по цепочке ДНК, на конец которой могут нанизываться новые молекулы Ku. У высших эукариот Ku образует комплекс с каталитической субъединицей ДНК-зависимой протеинкиназы (DNA-PKcs (англ.)) и образует полную ДНК-зависимую протеинкиназу, DNA-PK (англ.).[4] Ku, по-видимому, функционирует как молекулярный остов, к которому прикрепляются другие белки, принимающие участие в процессе NHEJ.

Перекрестно-комплементирующий белок репарации рентгеновских повреждений 5
Ku bound to DNA.png
Кристаллическая структура белка Ku человека, связанного с ДНК. Ku70 показан пурпурным, Ku80 синим, а цепочки ДНК зеленым.[1]
Обозначения
Символы XRCC5; Ku80
Entrez Gene 7520
HGNC 12833
OMIM 194364
PDB 1JEY
RefSeq NM_021141
UniProt P13010
Другие данные
Локус 2-я хр., 2q35
Wikidata-logo S.svg Информация в Викиданных ?
Перекрестно-комплементирующий белок репарации рентгеновских повреждений 6
Ku bound to DNA.png
Обозначения
Символы XRCC6; Ku70, G22P1
Entrez Gene 2547
HGNC 4055
OMIM 152690
PDB 1JEY
RefSeq NM_001469
UniProt P12956
Другие данные
Локус 22-я хр., 22q11 -q13
Wikidata-logo S.svg Информация в Викиданных ?

Обе субъединицы Ku были экспериментально удалены из генома мыши. Такие мыши имели различные хромосомные перестройки, что указывает на необходимость NHEJ для поддержания целостности генома.[5][6]

Во многих организмах Ku имеет дополнительные функции по поддержанию структуры теломер.[7]

Обилие Ku80 по-видимому, влияет на продолжительность жизни организмов.[8]

ПримечанияПравить

  1. PDB 1JEY; Walker J.R., Corpina R.A., Goldberg J. Structure of the Ku heterodimer bound to DNA and its implications for double-strand break repair (англ.) // Nature : journal. — 2001. — August (vol. 412, no. 6847). — P. 607—614. — doi:10.1038/35088000. — PMID 11493912.
  2. Doherty A.J., Jackson S.P., Weller G.R. Identification of bacterial homologues of the Ku DNA repair proteins (англ.) // FEBS Letters (англ.) : journal. — 2001. — July (vol. 500, no. 3). — P. 186—188. — doi:10.1016/S0014-5793(01)02589-3. — PMID 11445083.
  3. Walker J.R., Corpina R.A., Goldberg J. Structure of the Ku heterodimer bound to DNA and its implications for double-strand break repair (англ.) // Nature : journal. — 2001. — August (vol. 412, no. 6847). — P. 607—614. — doi:10.1038/35088000. — PMID 11493912.
  4. Carter T., Vancurová I., Sun I., Lou W., DeLeon S. A DNA-activated protein kinase from HeLa cell nuclei (англ.) // Molecular and Cellular Biology (англ.) : journal. — 1990. — December (vol. 10, no. 12). — P. 6460—6471. — PMID 2247066.
  5. Difilippantonio M.J., Zhu J., Chen H.T., Meffre E., Nussenzweig M.C., Max E.E., Ried T., Nussenzweig A. DNA repair protein Ku80 suppresses chromosomal aberrations and malignant transformation (англ.) // Nature : journal. — 2000. — March (vol. 404, no. 6777). — P. 510—514. — doi:10.1038/35006670. — PMID 10761921.
  6. Ferguson D.O., Sekiguchi J.M., Chang S., Frank K.M., Gao Y., DePinho R.A., Alt F.W. The nonhomologous end-joining pathway of DNA repair is required for genomic stability and the suppression of translocations (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2000. — June (vol. 97, no. 12). — P. 6630—6633. — doi:10.1073/pnas.110152897. — PMID 10823907.
  7. Boulton S.J., Jackson S.P. Components of the Ku-dependent non-homologous end-joining pathway are involved in telomeric length maintenance and telomeric silencing (англ.) // The EMBO Journal (англ.) : journal. — 1998. — March (vol. 17, no. 6). — P. 1819—1828. — doi:10.1093/emboj/17.6.1819. — PMID 9501103.
  8. Lorenzini A., Johnson F.B., Oliver A., Tresini M., Smith J.S., Hdeib M., Sell C., Cristofalo V.J., Stamato T.D. Significant correlation of species longevity with DNA double strand break recognition but not with telomere length (англ.) // Mech Ageing Dev. : journal. — 2009. — Nov-Dec (vol. 130, no. 11—12). — P. 784—792. — doi:10.1016/j.mad.2009.10.004. — PMID 19896964.