SOHLH1 (англ. spermatogenesis-and-oogenesis-specific basic helix-loop-helix containing protein 1 — сперматогенезно-оогенезный белок спираль петля спираль) — регулятор транскрипции дифференцировки зародышевой линии как у мужчин, так и у женщин.

SOHLH1
Идентификаторы
ПсевдонимыSOHLH1, C9orf157, NOHLH, SPATA27, TEB2, bA100C15.3, bHLHe80, spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, ODG5, SPGF32
Внешние IDOMIM: 610224 MGI: 2684956 HomoloGene: 45955 GeneCards: SOHLH1
Расположение гена (человек)
9-я хромосома человека
Хр.9-я хромосома человека[1]
9-я хромосома человека
Расположение в геноме SOHLH1
Расположение в геноме SOHLH1
Локус9q34.3Начало135,693,407 bp[1]
Конец135,704,498 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
2-я хромосома мыши
Хр.2-я хромосома мыши[2]
2-я хромосома мыши
Расположение в геноме SOHLH1
Расположение в геноме SOHLH1
Локус2|2 A3Начало25,733,007 bp[2]
Конец25,737,260 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001012415
NM_001101677

NM_001001714

RefSeq (белок)

NP_001012415
NP_001095147

NP_001001714

Локус (UCSC)Chr 9: 135.69 – 135.7 MbChr 2: 25.73 – 25.74 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

У мужчин подавляет гены, участвующие в поддержании сперматогониальных стволовых клеток, и индуцирует гены, важные для дифференцировки сперматогониев.

У женщин координирует дифференцировку яйцеклеток, не влияя на мейоз[5].

Дефицит SOHLH приводит к преждевременному и неостанавливающемуся мейозу в клетках.

Спираль-петля-спираль (basic helix-loop-helix, bHLH) — это базовый структурный мотив, имеющийся у многих белков, принадлежащих к суперсемейству димеризующихся факторов транскрипции. Эти белки и называют bHLH белками. Такая структура облегчают связывание молекул ДНК. В белковом мотиве, одна спираль меньше и, благодаря гибкости петли, позволяет димеризоваться путём фолдинга и упаковки против другой спирали (димер — белок состоящий из двух молекул). Большая спираль обычно содержит участки связывания ДНК.

Транскрипционные факторы bHLH являются гетеродимерными (Гетеродимер образуется двумя различными макромолекулами, в то время как Гомодимер — двумя одинаковыми молекулами). Поэтому их активность часто сильно регулируется димеризацией субъединиц. Экспрессия или доступность одной субъединицы часто контролируется, тогда как другая субъединица конститутивно экспрессируется. Многие из известных регуляторных белков, таких как белок Drosophila extramacrochaetae, имеют структуру спираль-петля-спираль, но не имеют базовой области, что делает их неспособными самостоятельно связываться с ДНК. Они, однако, способны образовывать гетеродимеры с белками, которые имеют структуру bHLH, и таким образом дезактивируют свои способности в качестве факторов транскрипции[6].

Не следует путать этот белковый структурный мотив с другим, похожим структурным мотивом белков — «спираль-поворот-спираль», которая также связывается с ДНК, но намного сильнее, а проворачиваемая вокруг оси петля, позволяет ей вступать в ряд межмолекулярных взаимодействий, таких как водородные мостики и вандервальские силы между аминокислотами и основаниями ДНК.

Примечания править

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165643 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059625 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Albertini, 2013, p. 134.
  6. Zeleznik, 2014, p. 956.

Литература править

  • Giovannni Coticchio, Davdi F. Albertini, Lucia De Santis. Oogenesis (англ.). — Springer Science & Business Media, 2013. — 361 p. — doi:10.007/978-0-85729-826-3.
  • Tony M. Plant, Anthony J. Zeleznik. Knobil and Neill’s Physiology of Reproduction (англ.). — Academic Press, 2014. — 2708 p. — ISBN 978-0-1239-7769-4.