XbaI - эндонуклеаза рестрикции, выделенна из бактерии Xanthomonas badrii [1].

XbaI
Идентификаторы
Шифр КФ 3.1.21.4
Базы ферментов
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
MetaCyc metabolic pathway
KEGG KEGG entry
PRIAM profile
PDB structures RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Поиск
PMC статьи
PubMed статьи
NCBI NCBI proteins

СвойстваПравить

XbaI относится к эндонуклеазам рестрикции (Тип II, подтип P). То есть XbaI распознает палиндромную последовательность ДНК и осуществляет рестрикцию внутри палиндрома в фиксированной точке. В присутствии диметилсульфоксида (ДМСО) и при высоких концентрациях глицерина в среде XbaI теряет способность распознавать палиндром и осуществляет неспецифическую рестрикцию (звёздная активность) [источник не указан 1286 дней]. После рестрикции образуются липкие концы с выступами из четырёх оснований.

Пример палиндромной последовательности, распознаваемой XbaI и образующиеся после рестрикции продукты
Палиндромный участок Продукты рестрикции
5'-TCTAGA-3'
3'-AGATCT-5'
5'-T       CTAGA-3'
3'-AGATC       T-5'

XbaI рестриктазная активность ингибируется при метилировании аденина (DAM метилаза). Однако, рестриктазная активность сохраняется при метилировании цитозина (DCM- или CpG-метилазы) [источник не указан 1286 дней].

После завершения рестрикции ДНК, XbaI может быть инактивирована денатурацией нагреванием до 65°C в течение 20 минут [источник не указан 1286 дней].

ПрименениеПравить

XbaI широко используется в молекулярно-биологических исследованиях. В частность XbaI применяется при клонировании специфических нуклеотидных последовательностей [2], при рестрикционном анализе.

Так например, XbaI использовалась при анализе полиморфизма рецептора эстрогена α[3]  и липопротеина а (ApoB)[4].

СсылкиПравить

  1. Biolabs, New England XbaI | NEB. www.neb.com. Дата обращения: 8 мая 2016.
  2. Principles and techniques of biochemistry and molecular biology. — 7th ed. — Cambridge, UK: Cambridge University Press, 2010. — xvi, 744 pages с. — ISBN 9780521516358.
  3. Hong Weng, Chao Zhang, Yuan-Yuan Hu, Rui-Xia Yuan, Hong-Xia Zuo. Association between Estrogen Receptor-αGene XbaI and PvuII Polymorphisms and Periodontitis Susceptibility: A Meta-Analysis (англ.) // Disease Markers. — 2015. — Vol. 2015. — P. 1–9. — ISSN 0278-0240. — doi:10.1155/2015/741972.
  4. Wei Gu, Mingduo Zhang, Shaojun Wen. Association between the APOB XbaI and EcoRI polymorphisms and lipids in Chinese: a meta-analysis (англ.) // Lipids in Health and Disease. — 2015/12. — Т. 14, вып. 1. — С. 123. — ISSN 1476-511X. — doi:10.1186/s12944-015-0125-z.