Сенсорный родопсин II
Се́нсорный родопси́н II (фо́бородопсин) — фотоактивный семиспиральный трансмембранный белок архей, служит им для отрицательного фототаксиса и относится к тому же семейству белков, что и бактериородопсин.
Структура править
В состав сенсорного родопсина II археи Natronomonas pharaonis входят 239 аминокислотных остатков, организованных в семь трансмембранных спиралей, и ретиналь, ковалентно связанный с лизином 205 посредством Шиффова основания.[1][2] Последовательность сенсорного родопсина II схожа с последовательностью бактериородопсина на 27 % (до 80 % в области ретиналь-содержащего кармана). Посредством точечных мутаций можно заставить действовать сенсорный родопсин в роли бактериородопсина, и наоборот.
Функция править
В мембране СРII образует комплекс с белком-трансдьюсером (передатчиком сигнала), и комплексы димеризуются. При поглощении фотона (максимум поглощения СРII приходится на 500 нм) сигнал с белка передается на трансдьюсер, и далее через киназы на жгутик. Таким образом бактерия может избегать вредный для неё около-УФ свет.
На данный момент известны структуры для основного состояния отдельного СРII в комплексе с трансдьюсером и промежуточных состояний для комплекса, при этом механизм функционирования белка также не выяснен до конца.[1][2]
См. также править
Примечания править
- ↑ 1 2 Grote M, Engelhard M, Hegemann P (2014) "Of ion pumps, sensors and channels - perspectives on microbial rhodopsins between science and history", Biochimica et Biophysica Acta 1837(5):533-45. doi: 10.1016/j.bbabio.2013.08.006
- ↑ 1 2 Spudich JL, Sineshchekov OA, Govorunova EG (2014) "Mechanism divergence in microbial rhodopsins", Biochimica et Biophysica Acta 1837(5):546-52. doi: 10.1016/j.bbabio.2013.06.006